87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1731 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  81.68 
 
 		 586 aa  996    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  84.42 
 
 		 588 aa  1021    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  86.3 
 
 		 587 aa  1019    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  81.85 
 
 		 586 aa  999    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  81.68 
 
 		 586 aa  996    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  84.42 
 
 		 588 aa  1021    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  81.68 
 
 		 586 aa  996    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  82.02 
 
 		 586 aa  998    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  84.42 
 
 		 588 aa  1021    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  81.68 
 
 		 586 aa  996    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  81.51 
 
 		 586 aa  994    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  81.51 
 
 		 586 aa  995    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  82.19 
 
 		 611 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  81.85 
 
 		 597 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  81.85 
 
 		 611 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  82.02 
 
 		 597 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  86.5 
 
 		 587 aa  1072    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  97.44 
 
 		 587 aa  1133    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  81.85 
 
 		 586 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  81.68 
 
 		 586 aa  997    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  81.68 
 
 		 586 aa  996    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1215    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  85.86 
 
 		 587 aa  1056    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  51.3 
 
 		 576 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  50.26 
 
 		 578 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  50.69 
 
 		 582 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  46.9 
 
 		 729 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  47.06 
 
 		 728 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  46.55 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  46.55 
 
 		 728 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  46.9 
 
 		 729 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  47.07 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  46.72 
 
 		 729 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  46.72 
 
 		 729 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  47.15 
 
 		 727 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  46.54 
 
 		 728 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  45.42 
 
 		 728 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  45.17 
 
 		 742 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  45.17 
 
 		 742 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  45.17 
 
 		 742 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  45.34 
 
 		 592 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  46.3 
 
 		 728 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  47.41 
 
 		 732 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  44.66 
 
 		 728 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  45.69 
 
 		 728 aa  538  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  44.31 
 
 		 728 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  47.83 
 
 		 735 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  48.12 
 
 		 734 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  46.32 
 
 		 728 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  47.17 
 
 		 616 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  46.31 
 
 		 734 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  47.17 
 
 		 734 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  46.08 
 
 		 728 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  46.08 
 
 		 728 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  46.06 
 
 		 731 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  45.9 
 
 		 728 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  46.31 
 
 		 734 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  46.02 
 
 		 734 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  47.87 
 
 		 592 aa  502  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  43.56 
 
 		 584 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  35.17 
 
 		 540 aa  343  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  35.81 
 
 		 536 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  27.35 
 
 		 618 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.82 
 
 		 575 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  31.43 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  28.85 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  27.24 
 
 		 580 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  25.17 
 
 		 745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  29.39 
 
 		 584 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.68 
 
 		 745 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  28.64 
 
 		 584 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  25 
 
 		 727 aa  51.2  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  23.47 
 
 		 745 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  23.47 
 
 		 745 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  23.72 
 
 		 353 aa  48.9  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  25.48 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  21.29 
 
 		 745 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  25.34 
 
 		 736 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  25.51 
 
 		 746 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  23.74 
 
 		 756 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  27.31 
 
 		 752 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  27.08 
 
 		 763 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  27.08 
 
 		 766 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.61 
 
 		 396 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  27.08 
 
 		 716 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  25.47 
 
 		 436 aa  44.3  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.71 
 
 		 844 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>