83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6320 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3627  hypothetical protein  29.32 
 
 
407 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  27.96 
 
 
416 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5193  hypothetical protein  34.53 
 
 
436 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.102029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  38.01 
 
 
757 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0841  hypothetical cytosolic protein  24.02 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  31.49 
 
 
769 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  26.15 
 
 
749 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  33.04 
 
 
644 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  31.05 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  31.58 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  40.16 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  28.19 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  31.01 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.8 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  26.25 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  35.48 
 
 
750 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  30.12 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  31.45 
 
 
752 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  27.53 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  30.28 
 
 
752 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.7 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  30.15 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.07 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  29.63 
 
 
746 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  36.67 
 
 
736 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  39.67 
 
 
745 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  31.06 
 
 
756 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.63 
 
 
727 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4752  hypothetical protein  31.08 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  41.67 
 
 
745 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  31.49 
 
 
763 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  31.49 
 
 
763 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  31.23 
 
 
443 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0543  YcaO-like protein  26.34 
 
 
420 aa  60.5  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  39.83 
 
 
745 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  39.83 
 
 
745 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.24 
 
 
420 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  39.5 
 
 
745 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  28.53 
 
 
607 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  31.06 
 
 
763 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  31.06 
 
 
716 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  29.49 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  30.71 
 
 
641 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  31.06 
 
 
766 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  31.06 
 
 
769 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  31.06 
 
 
844 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  28.57 
 
 
762 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  38.35 
 
 
657 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  28.5 
 
 
650 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  31.4 
 
 
572 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  34.13 
 
 
630 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  28.31 
 
 
649 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  32.64 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  30.72 
 
 
649 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  28.31 
 
 
649 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  28.86 
 
 
649 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  28.86 
 
 
649 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  33.88 
 
 
630 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  27.61 
 
 
649 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  27.52 
 
 
649 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  27.52 
 
 
649 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  27.52 
 
 
649 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  27.87 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  28.31 
 
 
649 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  30.67 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  32.14 
 
 
647 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  33.85 
 
 
438 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  34.96 
 
 
628 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1156  hypothetical protein  25.69 
 
 
204 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  38.89 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  33.56 
 
 
669 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  31.34 
 
 
882 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  25.75 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  31.16 
 
 
563 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  31.08 
 
 
555 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  32.67 
 
 
391 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  33.58 
 
 
582 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  27.4 
 
 
647 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  32.06 
 
 
575 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  30.14 
 
 
577 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  27.54 
 
 
644 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  34.15 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>