53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5193 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5193  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  859    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3627  hypothetical protein  33.17 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  28.33 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  34.53 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0841  hypothetical cytosolic protein  27.01 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4752  hypothetical protein  27.94 
 
 		 384 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0543  YcaO-like protein  25.4 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  35.42 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.09 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  40.62 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  31.62 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  29.75 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  28.22 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  31.25 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  28.65 
 
 		 745 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  32.68 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  30 
 
 		 757 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  24.15 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  24.56 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1753  protein of unknown function DUF181  26.56 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.65596  normal  0.50021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2097  hypothetical protein  26.56 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  38.28 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  23.84 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  25 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1156  hypothetical protein  27.34 
 
 		 204 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  27.76 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.43 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  23.31 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  28.38 
 
 		 745 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.36 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.76 
 
 		 745 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  28.18 
 
 		 575 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  27.7 
 
 		 745 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  27.7 
 
 		 745 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  24.26 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  29.49 
 
 		 769 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  30.71 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.78 
 
 		 752 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  29.39 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  23.73 
 
 		 750 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  34.59 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  29.2 
 
 		 647 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  26.83 
 
 		 749 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 584 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.02 
 
 		 727 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  34.4 
 
 		 575 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  34.44 
 
 		 644 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  25.29 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  34.96 
 
 		 582 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  26.23 
 
 		 752 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  29.69 
 
 		 585 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  32.09 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  34.65 
 
 		 736 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>