36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4752 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4752  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3627  hypothetical protein  29.5 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  25.12 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  31.75 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5193  hypothetical protein  28.08 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102029 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0543  YcaO-like protein  26.98 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  23 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0841  hypothetical cytosolic protein  24.03 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  24.9 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  28.18 
 
 		 752 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 766 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  26.75 
 
 		 752 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  28.38 
 
 		 769 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  25.42 
 
 		 630 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  28.38 
 
 		 844 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.15 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  27.95 
 
 		 763 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  26.55 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  27.95 
 
 		 716 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  27.95 
 
 		 763 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  24.72 
 
 		 403 aa  50.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  27.95 
 
 		 763 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.04 
 
 		 756 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  26.41 
 
 		 426 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  25.84 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  23.53 
 
 		 727 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  28.48 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  24.47 
 
 		 750 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  26.18 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  22.3 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  25 
 
 		 630 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  27.82 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  26.41 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  24.8 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.29 
 
 		 769 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>