29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2097 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2097  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1753  protein of unknown function DUF181  100 
 
 		 434 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.65596  normal  0.50021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  26.22 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  22.72 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0995  protein of unknown function DUF181  25.08 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  27.74 
 
 		 745 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  23.78 
 
 		 647 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  27.74 
 
 		 745 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  24.59 
 
 		 745 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  25.15 
 
 		 736 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.33 
 
 		 745 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  27.41 
 
 		 757 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  26.47 
 
 		 746 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.32 
 
 		 745 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  23.55 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  24.73 
 
 		 628 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  28.68 
 
 		 644 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 752 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  23.15 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  32.1 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5193  hypothetical protein  24.75 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.68 
 
 		 647 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0841  hypothetical cytosolic protein  27.83 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  23.82 
 
 		 669 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  25 
 
 		 750 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  31.34 
 
 		 649 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  31.34 
 
 		 649 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  21.15 
 
 		 763 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  21.15 
 
 		 763 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>