60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4916 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4916  UspA domain protein  100 
 
 
199 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
138 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.08 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.58 
 
 
140 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  27.85 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  24.65 
 
 
144 aa  48.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.66 
 
 
153 aa  48.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  25.85 
 
 
147 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
145 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.77 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  32.12 
 
 
271 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.47 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  28.08 
 
 
150 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
156 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  24.11 
 
 
144 aa  45.8  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  24.82 
 
 
288 aa  45.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.59 
 
 
139 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  27.27 
 
 
143 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  27.39 
 
 
162 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
156 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
144 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  25.78 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  25.78 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  24.82 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  25.78 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  25.78 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  25.35 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.71 
 
 
288 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  24.16 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  25.78 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  25.78 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  25.78 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  41.51 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  23.61 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  25.78 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  27.14 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  37.74 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.55 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  27.15 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  23.29 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  41.51 
 
 
140 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  28.67 
 
 
146 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  29.6 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.37 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  25.32 
 
 
161 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  41.51 
 
 
140 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  28.66 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  24.32 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  22.76 
 
 
285 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 
274 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28 
 
 
145 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  25.77 
 
 
156 aa  41.2  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>