100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1747 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  99.3 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  99.3 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  99.3 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  99.3 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  99.3 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  99.3 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  97.89 
 
 		 142 aa  286  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  76.76 
 
 		 142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  76.76 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  76.76 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  76.76 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  76.76 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  69.78 
 
 		 141 aa  206  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  48.2 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  39.86 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  39.16 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  40 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  39.16 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  38.57 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  39.16 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  39.29 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  39.29 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  39.29 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  39.29 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  39.29 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  38.57 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  34.04 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  35 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  33.57 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  33.57 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  32.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  32.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  32.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  32.14 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  31.47 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  30.82 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  33.1 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  32.17 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  29.79 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  29.71 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  28.57 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  30.07 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  25.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.37 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  22.54 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  22.54 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  26.32 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  25.52 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  23.28 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  23.61 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  27.97 
 
 		 310 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  26.39 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  22.54 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  27.46 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.49 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4916  UspA domain protein  25.78 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  27.46 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  24.83 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  23.61 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  23.53 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  22.88 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 154 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.09 
 
 		 138 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  27.59 
 
 		 310 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  25.19 
 
 		 316 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  24.83 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  23.97 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  27.97 
 
 		 310 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  29.05 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 155 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>