176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3852 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3852  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1201    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0226  hypothetical protein  26.38 
 
 		 593 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000930043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  24.3 
 
 		 617 aa  146  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  23.55 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  23.42 
 
 		 613 aa  143  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  26.21 
 
 		 614 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  27.73 
 
 		 607 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  27.73 
 
 		 607 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  27.73 
 
 		 607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  25.18 
 
 		 614 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  26.03 
 
 		 617 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  26.48 
 
 		 614 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  24.1 
 
 		 608 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  24.67 
 
 		 615 aa  137  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  23.16 
 
 		 624 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  25.11 
 
 		 616 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  25.11 
 
 		 616 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  25.11 
 
 		 616 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  23.85 
 
 		 613 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  25.11 
 
 		 616 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  24.63 
 
 		 602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  25 
 
 		 628 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  25.23 
 
 		 614 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  23.96 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  23.15 
 
 		 605 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  22.53 
 
 		 622 aa  127  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  22.2 
 
 		 627 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  24.95 
 
 		 625 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  22.06 
 
 		 628 aa  123  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  23.25 
 
 		 618 aa  123  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  23.72 
 
 		 611 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  22.09 
 
 		 587 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  22.1 
 
 		 629 aa  117  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  23.53 
 
 		 1283 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  23.3 
 
 		 610 aa  114  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  24.12 
 
 		 625 aa  113  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  21.69 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  23.44 
 
 		 546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  21.72 
 
 		 617 aa  110  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  22.12 
 
 		 616 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  22.76 
 
 		 608 aa  107  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  23.39 
 
 		 609 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  23.92 
 
 		 621 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  23 
 
 		 630 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  21.08 
 
 		 639 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  22.5 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  22.57 
 
 		 633 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  32.89 
 
 		 227 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  23.65 
 
 		 609 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  23.65 
 
 		 609 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  22.55 
 
 		 608 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  23.65 
 
 		 609 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  22.03 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  23.3 
 
 		 609 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  21.06 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  20.24 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  23.39 
 
 		 609 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  24.27 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  21.73 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  24.2 
 
 		 609 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  21.9 
 
 		 591 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  22.41 
 
 		 583 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  23.94 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  21.16 
 
 		 629 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  23.49 
 
 		 635 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  21.69 
 
 		 609 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  21.35 
 
 		 589 aa  100  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  20.23 
 
 		 585 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  23.49 
 
 		 635 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  23.94 
 
 		 609 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  23.49 
 
 		 635 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  23.15 
 
 		 590 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  24.59 
 
 		 566 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  21.41 
 
 		 551 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  24.26 
 
 		 609 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  24.37 
 
 		 609 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  23.43 
 
 		 611 aa  97.8  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  21.9 
 
 		 601 aa  97.4  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  21.86 
 
 		 636 aa  97.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  20.91 
 
 		 646 aa  95.1  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  22.55 
 
 		 603 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  19.86 
 
 		 610 aa  94  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  22.55 
 
 		 603 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  20.75 
 
 		 595 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  22.06 
 
 		 619 aa  93.2  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  22.57 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  21.75 
 
 		 613 aa  93.6  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  23.92 
 
 		 611 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  22.59 
 
 		 603 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  22.44 
 
 		 603 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  21.84 
 
 		 601 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  24.65 
 
 		 635 aa  92.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  21.56 
 
 		 601 aa  92  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  21.8 
 
 		 599 aa  92  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  24.65 
 
 		 637 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  21.39 
 
 		 601 aa  90.5  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  25.83 
 
 		 605 aa  90.5  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>