293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1333 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  100 
 
 
343 aa  713    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  55.22 
 
 
354 aa  398  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  55.52 
 
 
337 aa  381  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  48.37 
 
 
342 aa  325  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  48.34 
 
 
340 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  48.04 
 
 
338 aa  309  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  47.89 
 
 
340 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  47.58 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  46.69 
 
 
341 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  45.76 
 
 
340 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  46.36 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  46.39 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  45.92 
 
 
337 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  45.78 
 
 
337 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  45.02 
 
 
338 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  45.02 
 
 
354 aa  292  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  45.02 
 
 
341 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  45.11 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  41.87 
 
 
357 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  40.96 
 
 
353 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  42.61 
 
 
331 aa  268  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  42.61 
 
 
331 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  40.82 
 
 
344 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  40.29 
 
 
357 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  42.26 
 
 
320 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  41.85 
 
 
368 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  40 
 
 
327 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  40.57 
 
 
331 aa  255  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  41.27 
 
 
344 aa  255  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  39.88 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  40.06 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  39.88 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  39.13 
 
 
347 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  40 
 
 
337 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  39.24 
 
 
339 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  39.88 
 
 
348 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  41.62 
 
 
335 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  39.13 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  40.4 
 
 
352 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  39.13 
 
 
339 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  40.4 
 
 
352 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  39.71 
 
 
327 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  39.54 
 
 
350 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  39.71 
 
 
327 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  39.71 
 
 
327 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  39.59 
 
 
352 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  39.41 
 
 
327 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  38.84 
 
 
339 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  39.59 
 
 
352 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  41.69 
 
 
321 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  39.41 
 
 
337 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  39.41 
 
 
337 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  39.41 
 
 
337 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  39.41 
 
 
337 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  39.82 
 
 
355 aa  245  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  41.09 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  38.04 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  40.4 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  38.04 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  39.38 
 
 
345 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  39.42 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  39.1 
 
 
370 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  38.6 
 
 
371 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  39.48 
 
 
373 aa  242  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  38.81 
 
 
347 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  37.25 
 
 
345 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  40.8 
 
 
351 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  39.71 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  40 
 
 
367 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  38.29 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  41.16 
 
 
371 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  36.42 
 
 
343 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  39.47 
 
 
324 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  38.71 
 
 
337 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  40.23 
 
 
344 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  39.53 
 
 
360 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  39.01 
 
 
367 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  39.71 
 
 
353 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  39.04 
 
 
330 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  42.2 
 
 
362 aa  235  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  39.71 
 
 
350 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  41.99 
 
 
345 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  39.35 
 
 
340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  37.54 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  38.78 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  38.78 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  39.71 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  40.66 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  39.88 
 
 
365 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  38.18 
 
 
364 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  40 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_002950  PG0127  ferrochelatase  38.28 
 
 
345 aa  232  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  39.14 
 
 
378 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  38.48 
 
 
356 aa  231  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  38.73 
 
 
371 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  38.64 
 
 
369 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  39.02 
 
 
371 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  39.03 
 
 
328 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  38.15 
 
 
371 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  38.28 
 
 
354 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>