298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1001 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  85.44 
 
 		 371 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  100 
 
 		 371 aa  761    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  80.05 
 
 		 371 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  79.78 
 
 		 371 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  79.78 
 
 		 371 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  63.1 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  62.26 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  60.96 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  59.32 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  60.39 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  58.11 
 
 		 367 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  59.83 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  61.25 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  61.25 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  61.25 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  61.25 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  61.25 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  61.25 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  61.54 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  60 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  59.1 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  60.97 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  59.6 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  59.6 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  60.17 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  59.22 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  56.4 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  56.61 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  57.51 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  55.68 
 
 		 368 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  54.28 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  52.14 
 
 		 367 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  57.23 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  54.28 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  55.56 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  54.34 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  53.54 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  54.68 
 
 		 352 aa  359  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  54.68 
 
 		 352 aa  359  6e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  55.86 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  51.16 
 
 		 344 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.47 
 
 		 370 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  47.84 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  49.6 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  54.95 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  46.93 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.1 
 
 		 370 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  49.1 
 
 		 355 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  49.4 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46.86 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  50.91 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  50.91 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  48.2 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  47.9 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.55 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  47.6 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  47.6 
 
 		 327 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  47.42 
 
 		 337 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  47.6 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  47.6 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  47.31 
 
 		 337 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  47.31 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  47.84 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  47.27 
 
 		 337 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.58 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48.8 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  49.4 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  49.1 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  50.41 
 
 		 371 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  48.8 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  48.8 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  45.03 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  45.98 
 
 		 339 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  47.25 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  46.81 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  45.98 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  45.81 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  50.61 
 
 		 328 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  47.01 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  47.98 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  43.53 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  46.77 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  48.36 
 
 		 337 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  47.56 
 
 		 324 aa  301  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  46.22 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  45.4 
 
 		 339 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  46.46 
 
 		 320 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  45.67 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  46.55 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  48.31 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  46.5 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  48.41 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  45.65 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  46.25 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  45.99 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  45.99 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  46.08 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  45.99 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  45.03 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  45.03 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>