More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2019 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  100 
 
 
348 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  94.54 
 
 
348 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  94.54 
 
 
348 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  95.11 
 
 
348 aa  683    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  86.92 
 
 
347 aa  628  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  84.15 
 
 
339 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  84.15 
 
 
339 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  84.15 
 
 
339 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  83.84 
 
 
339 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  68.18 
 
 
331 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  68.26 
 
 
335 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  67.18 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  68.48 
 
 
337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  58.18 
 
 
320 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  58.49 
 
 
425 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  57.23 
 
 
320 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  58.68 
 
 
324 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  57.86 
 
 
321 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  54.63 
 
 
364 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  60.06 
 
 
320 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  58.31 
 
 
320 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  53.52 
 
 
368 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  53.96 
 
 
373 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  52.91 
 
 
369 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  55.97 
 
 
320 aa  361  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  55.97 
 
 
320 aa  361  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  55.97 
 
 
320 aa  361  9e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  53.21 
 
 
371 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  53.68 
 
 
370 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  51.24 
 
 
359 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  53.37 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  54.72 
 
 
320 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  51.07 
 
 
337 aa  348  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  51.07 
 
 
337 aa  348  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  55.24 
 
 
320 aa  345  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  47.68 
 
 
330 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  56.19 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  56.19 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  56.19 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  50.15 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  55.87 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  56.19 
 
 
320 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  55.87 
 
 
320 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  54.66 
 
 
320 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  54.66 
 
 
320 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  54.66 
 
 
320 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  55.87 
 
 
320 aa  338  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  54.92 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  52.94 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  54.66 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  55.87 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  54.34 
 
 
320 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  52.63 
 
 
352 aa  335  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  49.69 
 
 
370 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  49.39 
 
 
339 aa  333  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  48.61 
 
 
360 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  50.79 
 
 
355 aa  332  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  51.23 
 
 
367 aa  332  8e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.63 
 
 
337 aa  332  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  48.17 
 
 
339 aa  331  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  47.87 
 
 
339 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  50.63 
 
 
327 aa  329  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  50.31 
 
 
363 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  50.15 
 
 
367 aa  329  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  50.46 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  49.38 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  49.84 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  50.62 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  48.15 
 
 
344 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  51.63 
 
 
365 aa  325  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  50.46 
 
 
369 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.61 
 
 
370 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  49.84 
 
 
340 aa  322  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  50 
 
 
327 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  50 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  49.68 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  50.46 
 
 
356 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  49.37 
 
 
337 aa  318  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  51.82 
 
 
354 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  51.26 
 
 
322 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  48.62 
 
 
365 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  50.93 
 
 
398 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  49.69 
 
 
368 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  48.87 
 
 
325 aa  316  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  49.37 
 
 
337 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  49.37 
 
 
337 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  48.93 
 
 
356 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  49.05 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  47.83 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  48.93 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  49.05 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1047  ferrochelatase  49.22 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  48.8 
 
 
371 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  48.1 
 
 
337 aa  309  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  49.85 
 
 
355 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  49.24 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  49.24 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  49.24 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.73 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  48.17 
 
 
364 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>