275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1077 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  100 
 
 		 340 aa  695    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  81.52 
 
 		 341 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  80.94 
 
 		 340 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  80.94 
 
 		 340 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  76.56 
 
 		 337 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  74.26 
 
 		 338 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  73.89 
 
 		 337 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  76.65 
 
 		 338 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  73.37 
 
 		 338 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  72.22 
 
 		 340 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  72.4 
 
 		 340 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  50 
 
 		 342 aa  342  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  46.34 
 
 		 354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  48.77 
 
 		 337 aa  319  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  47.58 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  48.05 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  47.51 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  44.87 
 
 		 354 aa  282  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  44.57 
 
 		 341 aa  278  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  44.41 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  41.3 
 
 		 331 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  40.66 
 
 		 344 aa  258  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  41.21 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  41.79 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  41.28 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  41.85 
 
 		 327 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  40.88 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  40.88 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  41.45 
 
 		 335 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  39.88 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  39.29 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  40.88 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  38.42 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  39.42 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  40.7 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  38.6 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  40.67 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  40.67 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  41.06 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  40.37 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  38.71 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  39.66 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  36.98 
 
 		 353 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  38.69 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  39.65 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  38.79 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  38.42 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  38.42 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  40.99 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  36.8 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0127  ferrochelatase  38.14 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  40.37 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  35.78 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  40.85 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  36.8 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  36.5 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  42.26 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  39.71 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  39.52 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  38.17 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  38.95 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  35.99 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  39.36 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  41.94 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  38.66 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  38.66 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  38.84 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  38.08 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  36.81 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  38.24 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  39.51 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  36.84 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  39.34 
 
 		 320 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  37.93 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  37.97 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  37.13 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  37.46 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  38.39 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  38.26 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  36.78 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  39.35 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  36.26 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  39.66 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  37.8 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  37.39 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  37.28 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  36.6 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  39.09 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  37.24 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  37.13 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  38.79 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  38.79 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  36.5 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  39.02 
 
 		 354 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  36.98 
 
 		 378 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  35.52 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  37.43 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  36.25 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  36.15 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  37.09 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>