More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0733 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  100 
 
 
356 aa  737    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  98.6 
 
 
356 aa  725    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  89.91 
 
 
356 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  80.12 
 
 
354 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  80.28 
 
 
367 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  80.56 
 
 
367 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  80.56 
 
 
367 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  81.48 
 
 
355 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  82.37 
 
 
355 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  80.28 
 
 
367 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  80.28 
 
 
367 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  80.28 
 
 
367 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  80.28 
 
 
367 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  81.84 
 
 
354 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  80.98 
 
 
354 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  81.84 
 
 
354 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  80.69 
 
 
354 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  80.4 
 
 
354 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  60.39 
 
 
371 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  60.11 
 
 
371 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  60.4 
 
 
371 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  59.26 
 
 
371 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  59.26 
 
 
371 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  56.13 
 
 
367 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  55.86 
 
 
364 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  57.14 
 
 
367 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  56.98 
 
 
367 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  54.76 
 
 
369 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  52.42 
 
 
363 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  53.94 
 
 
364 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  54.98 
 
 
370 aa  371  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  54.36 
 
 
368 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  53.69 
 
 
367 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  56.63 
 
 
352 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  56.63 
 
 
352 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  55.23 
 
 
398 aa  362  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  53.01 
 
 
365 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  56.12 
 
 
354 aa  358  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  52.16 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  53.64 
 
 
365 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  54.82 
 
 
354 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  52.46 
 
 
369 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  49.71 
 
 
370 aa  322  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  49.54 
 
 
348 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  49.54 
 
 
348 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  50.76 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  45.56 
 
 
359 aa  318  9e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  49.24 
 
 
348 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  48.01 
 
 
339 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  48.01 
 
 
339 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  44.77 
 
 
360 aa  315  6e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  48.41 
 
 
364 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  47.71 
 
 
339 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  48.93 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  46.65 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  46.65 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  46.65 
 
 
368 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  47.09 
 
 
347 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  47.4 
 
 
339 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  47.01 
 
 
355 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  47.31 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  48.89 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  47.46 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  48.21 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  46.67 
 
 
339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  46.53 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  52.11 
 
 
371 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  46.5 
 
 
327 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  46.63 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  46.69 
 
 
337 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  46.38 
 
 
342 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  45.26 
 
 
331 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  44.85 
 
 
339 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  46.6 
 
 
320 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  51.37 
 
 
336 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  45.48 
 
 
324 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.16 
 
 
378 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  45.82 
 
 
320 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  45.82 
 
 
320 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  45.48 
 
 
337 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  45.82 
 
 
320 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  46.67 
 
 
353 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  44.95 
 
 
320 aa  289  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  45.76 
 
 
327 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  45.12 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  45.4 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  46.01 
 
 
327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  45.61 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  44.88 
 
 
337 aa  289  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  45.68 
 
 
320 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  45.68 
 
 
320 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  50.91 
 
 
331 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  44.6 
 
 
351 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  46.44 
 
 
425 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3991  ferrochelatase  47.4 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.4603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  46.11 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  46.11 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  45.4 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  44.74 
 
 
362 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  46.67 
 
 
344 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>