More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3987 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  100 
 
 		 360 aa  758    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  64.72 
 
 		 359 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  60.17 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  53.85 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  54.84 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  52.86 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  59.21 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  50.96 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  50.68 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  53.58 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  48.4 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  53.99 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  53.99 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  53.87 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  54.18 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  53.42 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  51.33 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.92 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  49.7 
 
 		 365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  51.02 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  51.53 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  47.96 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  47.28 
 
 		 367 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  48.22 
 
 		 368 aa  358  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  50.92 
 
 		 327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  52.45 
 
 		 337 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  50.76 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  51.07 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  50.31 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  49.24 
 
 		 343 aa  351  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  50 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  50 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  49.55 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  49.7 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  47.73 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  46.01 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  46.61 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  48 
 
 		 337 aa  342  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  48 
 
 		 337 aa  342  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  47.59 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  47.13 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  47.59 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  47.59 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  52.32 
 
 		 328 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  47.29 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  48.64 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.26 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  46.93 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  47.76 
 
 		 364 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  46.26 
 
 		 371 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  50.95 
 
 		 320 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  46.93 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  49.84 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  49.84 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  49.84 
 
 		 320 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  51.1 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  49.69 
 
 		 320 aa  335  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  50.95 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  50.95 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  50.95 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  47.69 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  48.61 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  47.99 
 
 		 348 aa  332  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  50.63 
 
 		 320 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  49.09 
 
 		 354 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  46.51 
 
 		 354 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  47.62 
 
 		 338 aa  328  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  47.22 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  47.37 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  44.81 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  46.55 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  46.31 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  48.62 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  46.22 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  46.41 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  46.41 
 
 		 352 aa  326  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  48.44 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  47.76 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  46.13 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  45.11 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  46.34 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  47.42 
 
 		 370 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  48.64 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  48.64 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  48.64 
 
 		 367 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  48.64 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  48.64 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  48.64 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  48.64 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  49.84 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  49.84 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  49.84 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  49.84 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  49.53 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  49.53 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  49.53 
 
 		 320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  49.53 
 
 		 320 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  47.15 
 
 		 352 aa  318  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  47.15 
 
 		 352 aa  318  7e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  47.87 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>