More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2846 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  100 
 
 		 335 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  73.64 
 
 		 331 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  72.14 
 
 		 327 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  72.84 
 
 		 337 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  69.46 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  69.23 
 
 		 339 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  69.67 
 
 		 347 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  68.07 
 
 		 339 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  68.56 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  68.56 
 
 		 348 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  67.47 
 
 		 339 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  68.26 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  67.77 
 
 		 339 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  55.35 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  58.41 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  56.96 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  53.23 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  56.51 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  50.61 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  53.46 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  54.09 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  50.46 
 
 		 369 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  49.4 
 
 		 371 aa  360  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  48.77 
 
 		 330 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  52.78 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  52.78 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  52.78 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  50.15 
 
 		 368 aa  358  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  49.54 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  50.46 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  50.46 
 
 		 337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  53.46 
 
 		 320 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  48.3 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  55.03 
 
 		 320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  50.77 
 
 		 328 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  51.58 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  52.52 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  50.94 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  53.48 
 
 		 320 aa  345  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  50 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  50.16 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  50.48 
 
 		 337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  49.84 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  49.21 
 
 		 337 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  49.84 
 
 		 327 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  49.84 
 
 		 327 aa  342  8e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  50 
 
 		 355 aa  341  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  50.77 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  50.77 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  48.63 
 
 		 365 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  50.16 
 
 		 337 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  50.16 
 
 		 337 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  46.71 
 
 		 370 aa  338  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  49.39 
 
 		 368 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  49.84 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  52.38 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  52.38 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  52.38 
 
 		 320 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  52.38 
 
 		 320 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.13 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  49.52 
 
 		 337 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  49.52 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  52.38 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  47.06 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  51.4 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  48.77 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  48.78 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  47.83 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  52.06 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  52.06 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  49.23 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  52.06 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  52.06 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  51.75 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  51.43 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  48.45 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  51.75 
 
 		 320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  51.75 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  51.75 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  48 
 
 		 338 aa  322  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  48.19 
 
 		 365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  46.41 
 
 		 371 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  48.91 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  46.62 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  47.27 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  50.46 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  45.18 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  47.26 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  50.46 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1047  ferrochelatase  46.86 
 
 		 376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  44.74 
 
 		 344 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  44.58 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  45.67 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  46.65 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  43.98 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  45.97 
 
 		 371 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  48 
 
 		 398 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  44.51 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  47.24 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  47.85 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>