More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2440 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  95.11 
 
 
348 aa  683    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  88.37 
 
 
347 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  98.56 
 
 
348 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  99.14 
 
 
348 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  100 
 
 
348 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  84.76 
 
 
339 aa  590  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  83.13 
 
 
339 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  84.45 
 
 
339 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  84.45 
 
 
339 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  69.46 
 
 
335 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  68.18 
 
 
331 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  66.56 
 
 
327 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  68.45 
 
 
337 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  58.49 
 
 
320 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  58.81 
 
 
425 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  58.18 
 
 
321 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  57.55 
 
 
320 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  58.99 
 
 
324 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  60.38 
 
 
320 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  54.8 
 
 
364 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  58.62 
 
 
320 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  53.21 
 
 
368 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  56.29 
 
 
320 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  56.29 
 
 
320 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  56.29 
 
 
320 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  53.54 
 
 
373 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  51.39 
 
 
359 aa  360  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  51.99 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  55.03 
 
 
320 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  52.29 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  53.07 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  52.45 
 
 
328 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  55.24 
 
 
320 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  47.99 
 
 
330 aa  345  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  50.46 
 
 
337 aa  344  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  50.46 
 
 
337 aa  344  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  50.76 
 
 
378 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  56.19 
 
 
320 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  53.97 
 
 
320 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  50.46 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  53.97 
 
 
320 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  53.97 
 
 
320 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  55.56 
 
 
320 aa  339  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  55.87 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  55.87 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  55.87 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  55.87 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  53.97 
 
 
320 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  55.56 
 
 
320 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  55.56 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  54.6 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  52.63 
 
 
352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  53.65 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  52 
 
 
369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  52.63 
 
 
352 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  50 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  50.95 
 
 
327 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.63 
 
 
337 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  50.48 
 
 
355 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  50.31 
 
 
363 aa  332  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  47.99 
 
 
360 aa  332  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  50.15 
 
 
345 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  49.84 
 
 
343 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  49.08 
 
 
339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  50 
 
 
367 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  50.32 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  50.31 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  50.32 
 
 
327 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  48.76 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  51.04 
 
 
365 aa  325  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  49.68 
 
 
337 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.61 
 
 
370 aa  324  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  50 
 
 
327 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  51.26 
 
 
322 aa  322  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  49.54 
 
 
356 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  51.82 
 
 
354 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  49.54 
 
 
356 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  50.31 
 
 
368 aa  321  9.000000000000001e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  46.95 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  48.7 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  47.06 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  46.65 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  49.37 
 
 
337 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  49.37 
 
 
337 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  49.85 
 
 
356 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  48.1 
 
 
325 aa  318  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  49.05 
 
 
337 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  49.05 
 
 
337 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  49.4 
 
 
371 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  53.42 
 
 
371 aa  315  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  50.62 
 
 
398 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  48.1 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1047  ferrochelatase  49.22 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  47.4 
 
 
365 aa  312  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  47.78 
 
 
337 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  49.85 
 
 
355 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  49.24 
 
 
367 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  49.39 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  49.24 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.73 
 
 
354 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>