299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1039 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  100 
 
 
354 aa  738    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  61.54 
 
 
355 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  60.37 
 
 
337 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  60.49 
 
 
337 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  59.88 
 
 
327 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  59.88 
 
 
327 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  59.88 
 
 
327 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  60 
 
 
327 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  57.93 
 
 
340 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  60.99 
 
 
337 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  60.99 
 
 
337 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  60.68 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  56.37 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  58.21 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  60.68 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  56.65 
 
 
337 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  57.31 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  52.52 
 
 
359 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  52.85 
 
 
364 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  53.77 
 
 
370 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  53.89 
 
 
378 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  51.33 
 
 
360 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  52.96 
 
 
370 aa  358  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  52.53 
 
 
373 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  49.24 
 
 
371 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  50.45 
 
 
369 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  50.62 
 
 
327 aa  339  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  51.25 
 
 
363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  48.12 
 
 
368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  48.94 
 
 
325 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  48.76 
 
 
337 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  48.76 
 
 
337 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  51.27 
 
 
335 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  50.16 
 
 
320 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  55.81 
 
 
371 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  49.22 
 
 
425 aa  331  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  48.04 
 
 
321 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  48.16 
 
 
320 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  49.38 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  50.61 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  51.08 
 
 
367 aa  326  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  46.27 
 
 
324 aa  326  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  48.76 
 
 
348 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  48.44 
 
 
320 aa  325  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  48.32 
 
 
348 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  48.01 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  46.39 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  46.39 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  48.36 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  46.39 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  47.43 
 
 
365 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  49.06 
 
 
368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  48.97 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  49.38 
 
 
328 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  46.9 
 
 
352 aa  316  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  46.9 
 
 
352 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  46.63 
 
 
370 aa  316  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  45.57 
 
 
320 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  45.57 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  45.57 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  45.57 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  46.55 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  46.42 
 
 
320 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  46.89 
 
 
339 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  45.57 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  48.1 
 
 
331 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  46.89 
 
 
339 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  47.68 
 
 
339 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  46.88 
 
 
347 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  47.2 
 
 
339 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  49.39 
 
 
364 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  46.58 
 
 
339 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  47.34 
 
 
352 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  47.34 
 
 
352 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  49.4 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  45.95 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  46.46 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  45.79 
 
 
320 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  47.48 
 
 
367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  46.86 
 
 
348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  48.62 
 
 
398 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  49.06 
 
 
354 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  45.2 
 
 
351 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  45.15 
 
 
362 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  45.48 
 
 
367 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  47.6 
 
 
330 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  45.21 
 
 
371 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.29 
 
 
354 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  46.42 
 
 
320 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  44.79 
 
 
320 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  44.79 
 
 
320 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  44.79 
 
 
320 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  44.79 
 
 
320 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.44 
 
 
344 aa  295  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  46.5 
 
 
371 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  44.48 
 
 
320 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  44.48 
 
 
320 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  44.48 
 
 
320 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  43.85 
 
 
370 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  48.18 
 
 
364 aa  292  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>