More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1486 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  100 
 
 
364 aa  752    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  89.81 
 
 
364 aa  681    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  62.26 
 
 
371 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  59.78 
 
 
371 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  61.95 
 
 
371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  59.72 
 
 
371 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  60.7 
 
 
371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  56.02 
 
 
365 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  54.81 
 
 
356 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  55.59 
 
 
356 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  53.98 
 
 
354 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  55.49 
 
 
367 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  53.94 
 
 
356 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  55.81 
 
 
367 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  55.81 
 
 
367 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  55.81 
 
 
367 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  55.81 
 
 
367 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  55.81 
 
 
367 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  55.81 
 
 
367 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  55.81 
 
 
367 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  55.59 
 
 
363 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  53.39 
 
 
367 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  56.4 
 
 
355 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  54.57 
 
 
354 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  55.52 
 
 
365 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  54.52 
 
 
367 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  54.28 
 
 
354 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  53.62 
 
 
369 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  54.95 
 
 
354 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  55.26 
 
 
355 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  53.22 
 
 
368 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  53.98 
 
 
354 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  53.98 
 
 
354 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  50.45 
 
 
359 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  53.01 
 
 
370 aa  358  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  55.39 
 
 
367 aa  355  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  48.76 
 
 
368 aa  355  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  54.41 
 
 
369 aa  355  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  55.03 
 
 
398 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  51.54 
 
 
371 aa  354  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  54.1 
 
 
352 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  51.19 
 
 
344 aa  347  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  54.1 
 
 
352 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.15 
 
 
337 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  49.86 
 
 
370 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  50.15 
 
 
355 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  51.64 
 
 
364 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  53.12 
 
 
354 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  47.76 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  55.02 
 
 
354 aa  335  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  50.3 
 
 
337 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  50.3 
 
 
337 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  48.34 
 
 
327 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  48.34 
 
 
327 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.89 
 
 
370 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  48.34 
 
 
327 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  48.04 
 
 
327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  48.04 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  49.08 
 
 
337 aa  325  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  46.9 
 
 
345 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  46.53 
 
 
337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  49.55 
 
 
340 aa  323  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  49.7 
 
 
373 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  46.53 
 
 
337 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  45.99 
 
 
343 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  46.22 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  46.22 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  52.38 
 
 
371 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  48.25 
 
 
338 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  47.18 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  49.21 
 
 
325 aa  311  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  46.59 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  46.59 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  46.47 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  46.88 
 
 
360 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  47.94 
 
 
344 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  49.55 
 
 
327 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  46.47 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48.48 
 
 
347 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  46.18 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  47.06 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  47.34 
 
 
351 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  46.18 
 
 
339 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  47.87 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.58 
 
 
378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  46.63 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  47.56 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  46.29 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  48.18 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  47.56 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  47.26 
 
 
348 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  46.77 
 
 
324 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  46.04 
 
 
331 aa  295  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  46.83 
 
 
350 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  45.96 
 
 
320 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  49.09 
 
 
328 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  45.65 
 
 
345 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  47.27 
 
 
345 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  46.58 
 
 
320 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  46.58 
 
 
320 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>