More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0734 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  88.33 
 
 
356 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  88.89 
 
 
356 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  88.33 
 
 
356 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  100 
 
 
360 aa  744    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  85.04 
 
 
360 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  83.66 
 
 
360 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  68.7 
 
 
353 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  62.5 
 
 
344 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  60.9 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  60.42 
 
 
350 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  58.88 
 
 
348 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  60.12 
 
 
344 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  59.46 
 
 
352 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  58.26 
 
 
350 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  59.46 
 
 
352 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  58.11 
 
 
351 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  61.04 
 
 
345 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  60.74 
 
 
347 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  54.94 
 
 
370 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  54.52 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  56.42 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  57.67 
 
 
345 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  56.89 
 
 
353 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  57.36 
 
 
370 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  57.98 
 
 
345 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  55.03 
 
 
354 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  57.36 
 
 
345 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  52.86 
 
 
377 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  51.27 
 
 
377 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  51.27 
 
 
377 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  53.05 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  50.59 
 
 
343 aa  349  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  51.37 
 
 
342 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  53.7 
 
 
331 aa  328  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  50.6 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  51.99 
 
 
371 aa  325  5e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  53.43 
 
 
336 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  49.7 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  49.85 
 
 
373 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  47.09 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46.22 
 
 
359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  47.18 
 
 
364 aa  309  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  49.71 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  48.19 
 
 
371 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  48.19 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.73 
 
 
378 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  48.62 
 
 
337 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  48.16 
 
 
368 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  46.77 
 
 
327 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  46.88 
 
 
364 aa  298  9e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  47.59 
 
 
371 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  46.55 
 
 
367 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  46.93 
 
 
363 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  46.44 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  46.46 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  46.34 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  46.46 
 
 
355 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  44.44 
 
 
368 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  47.55 
 
 
369 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  45.18 
 
 
367 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  45.43 
 
 
364 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  46.5 
 
 
370 aa  292  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  46.08 
 
 
371 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.62 
 
 
370 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  44.55 
 
 
337 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  46.83 
 
 
354 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  50.46 
 
 
371 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  41.94 
 
 
345 aa  288  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  46.48 
 
 
337 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  46.48 
 
 
337 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  46.53 
 
 
356 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  44.31 
 
 
337 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  46.83 
 
 
356 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  45.23 
 
 
337 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  44.82 
 
 
367 aa  285  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  45.23 
 
 
337 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  44.58 
 
 
371 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  45.23 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  45.23 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  45.22 
 
 
369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  43.21 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  45.09 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  46.22 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.7 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  44.27 
 
 
354 aa  282  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  41.71 
 
 
352 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  47.24 
 
 
398 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  41.71 
 
 
352 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  39.82 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  47.66 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  41.41 
 
 
331 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  47.13 
 
 
354 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  44.48 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>