More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1470 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  100 
 
 		 356 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  98.31 
 
 		 356 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  88.33 
 
 		 360 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  100 
 
 		 356 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  84.68 
 
 		 360 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  82.17 
 
 		 360 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  70.29 
 
 		 353 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  63.8 
 
 		 344 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  58.09 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  60.71 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  60.06 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  60.48 
 
 		 345 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  59.3 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  59.3 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  58.09 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  58.02 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  61.04 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  56.18 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  61.04 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  55.72 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  55.92 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  58.28 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  58.04 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  55.65 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  57.98 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  54.09 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  57.36 
 
 		 345 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  52.2 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  51.78 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  51.78 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  51.22 
 
 		 370 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  52 
 
 		 342 aa  348  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  48.25 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  52.78 
 
 		 331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  52.24 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  50.91 
 
 		 371 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  49.7 
 
 		 337 aa  322  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  48.66 
 
 		 365 aa  322  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.48 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  48.32 
 
 		 373 aa  311  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  46.88 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  49.54 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  44.85 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  47.48 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.99 
 
 		 371 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  46.99 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  45.43 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  46.32 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.12 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  45.87 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  45.87 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  46.59 
 
 		 364 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  45.17 
 
 		 337 aa  298  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  46.08 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  47.08 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  45.45 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  45.67 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  45.48 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.32 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  42.23 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  45.71 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  44.55 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  44.14 
 
 		 340 aa  292  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  44.51 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  50.91 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  43.29 
 
 		 354 aa  289  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  44.87 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  43.64 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  44.57 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  43.98 
 
 		 367 aa  285  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  44.62 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  44.62 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  44.62 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  44.62 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  43.19 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  44.88 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  40.41 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  44.17 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  45.4 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  45.4 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  43.7 
 
 		 371 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  45.45 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.03 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  42.57 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  43.88 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  44.58 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  42.33 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  43.07 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  42.46 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  42.46 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  45.75 
 
 		 367 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  45.75 
 
 		 367 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  45.75 
 
 		 367 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  44.57 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  44.62 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  45.75 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  45.75 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  45.75 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  45.75 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  46.33 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>