299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1545 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  100 
 
 		 369 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  70.49 
 
 		 367 aa  541  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  68.87 
 
 		 367 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  68.41 
 
 		 365 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  69.01 
 
 		 363 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  70.76 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  61.6 
 
 		 368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  65.63 
 
 		 352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  58.95 
 
 		 367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  66.67 
 
 		 354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  65.33 
 
 		 352 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  66.46 
 
 		 354 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  57.07 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  59.18 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  56.25 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  56.22 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  55.95 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  55.83 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  55.49 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  56.07 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  55.82 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  54.76 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  56.36 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  54.47 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  53.71 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  56.07 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  56.07 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  56.07 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  56.07 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  56.07 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  56.07 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  56.17 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  56.94 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  50.82 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  54.15 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  54 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  54.62 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  50.7 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  53.85 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  52.62 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  50 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  52.31 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  48.68 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  52.31 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  54 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  54.62 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  52 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  54.73 
 
 		 354 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  52 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  52.35 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  52.31 
 
 		 327 aa  363  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  54.34 
 
 		 355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  54.08 
 
 		 370 aa  359  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  52 
 
 		 327 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  52 
 
 		 327 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  49.31 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  50.77 
 
 		 337 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  51.86 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  51.86 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  52.07 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  51.25 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  50.89 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  49.41 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.88 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  48.65 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  48.63 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  48.64 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  52 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  52 
 
 		 348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  51.69 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  50.15 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  48.15 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  49.54 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  49.54 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  50.46 
 
 		 348 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  48 
 
 		 331 aa  326  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  48.92 
 
 		 339 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  49.23 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  47.2 
 
 		 340 aa  322  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  48.96 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  48.45 
 
 		 327 aa  319  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  48.78 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  50.93 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3991  ferrochelatase  50.97 
 
 		 320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.4603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  51.97 
 
 		 371 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  48.46 
 
 		 337 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  47.5 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  52.78 
 
 		 331 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  47.96 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  47.96 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  46.25 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03842  ferrochelatase  46.3 
 
 		 321 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  45.87 
 
 		 339 aa  298  9e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  45.45 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  47.24 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  45.62 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  45.62 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  45.62 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  43.25 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  44.77 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>