More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2471 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  94.34 
 
 		 371 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  99.19 
 
 		 371 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  100 
 
 		 371 aa  767    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  80.05 
 
 		 371 aa  628  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  79.25 
 
 		 371 aa  624  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  61.97 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  61.95 
 
 		 364 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  58.76 
 
 		 354 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  56.84 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  59.83 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  59.32 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  59.26 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  61.65 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  61.65 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  62.75 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  61.65 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  61.65 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  61.65 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  61.65 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  61.65 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  58.82 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  59.32 
 
 		 354 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  59.32 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  56.95 
 
 		 365 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  55.61 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  58.1 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  54.28 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  58.1 
 
 		 355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  57.35 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  58.1 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  57.47 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  56.33 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  57.31 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  54.86 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  54.86 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  56.16 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  52.6 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  53.58 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  54.65 
 
 		 352 aa  355  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  54.65 
 
 		 352 aa  356  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  56.33 
 
 		 354 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46.85 
 
 		 359 aa  349  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  46.77 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  50 
 
 		 370 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  55.09 
 
 		 354 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  47.71 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.26 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  49.56 
 
 		 371 aa  335  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  45.53 
 
 		 368 aa  332  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  51.52 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  51.52 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  47.9 
 
 		 337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  47.01 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  47.6 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  47.6 
 
 		 337 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  47.6 
 
 		 337 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  47.01 
 
 		 327 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  47.31 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  47.01 
 
 		 327 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  47.31 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  47.9 
 
 		 355 aa  322  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  46.71 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  47.11 
 
 		 337 aa  319  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  51.59 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  47.72 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.19 
 
 		 378 aa  308  6.999999999999999e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  48.18 
 
 		 348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  48.2 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  48.18 
 
 		 348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48.48 
 
 		 347 aa  305  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  47.9 
 
 		 345 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  48.19 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  44.15 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  46.99 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  46.99 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  48.29 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  47.88 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  45.51 
 
 		 338 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  46.99 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  49.2 
 
 		 339 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  47.76 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  47.26 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  47.58 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  48.05 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  47.58 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  49.2 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  49.2 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  46.99 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  48.36 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  44.85 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  49.36 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  46.69 
 
 		 360 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  47.15 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  47.16 
 
 		 353 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  43.24 
 
 		 343 aa  295  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  46.69 
 
 		 353 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  49.36 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  48.88 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  47.29 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  45.97 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>