More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2579 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  100 
 
 
360 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  92.22 
 
 
360 aa  688    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  85.04 
 
 
360 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  84.4 
 
 
356 aa  621  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  84.68 
 
 
356 aa  623  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  84.68 
 
 
356 aa  623  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  70.41 
 
 
353 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  61.72 
 
 
344 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  58.91 
 
 
348 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  58.51 
 
 
345 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  57.14 
 
 
350 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  57.14 
 
 
344 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  57.96 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  57.96 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  53.61 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  57.64 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  55.22 
 
 
353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  57.67 
 
 
350 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  58.9 
 
 
347 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  56.34 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  56.75 
 
 
345 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  53.09 
 
 
362 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  55.99 
 
 
353 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  56.13 
 
 
345 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  54.97 
 
 
370 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  55.83 
 
 
345 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  52.19 
 
 
354 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  53.14 
 
 
377 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  52.29 
 
 
377 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  52.29 
 
 
377 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  50.15 
 
 
343 aa  348  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  49.85 
 
 
370 aa  343  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  51.37 
 
 
342 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  54.76 
 
 
336 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  50.76 
 
 
371 aa  322  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  50.15 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  53.09 
 
 
331 aa  318  6e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  47.87 
 
 
360 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  51.22 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46.04 
 
 
359 aa  309  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  49.09 
 
 
365 aa  309  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  46.88 
 
 
364 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  48.47 
 
 
368 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  48.16 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  46.79 
 
 
373 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.69 
 
 
371 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.73 
 
 
378 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  46.36 
 
 
367 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  47.06 
 
 
364 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  46.69 
 
 
371 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  44.75 
 
 
337 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  47.24 
 
 
363 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  44.04 
 
 
368 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  45.78 
 
 
371 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  45.79 
 
 
337 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  45.23 
 
 
367 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.01 
 
 
370 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  44.24 
 
 
327 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  43.3 
 
 
337 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  44.14 
 
 
327 aa  289  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  44.24 
 
 
327 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  43.21 
 
 
340 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.51 
 
 
354 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  43.38 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  49.39 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  44.55 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  43.47 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  46.53 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  45.18 
 
 
371 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  43.48 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  46.32 
 
 
337 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  45.62 
 
 
356 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  46.32 
 
 
337 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  43.93 
 
 
369 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  43.9 
 
 
367 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  41.64 
 
 
345 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  43.93 
 
 
337 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  43.93 
 
 
337 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  43.61 
 
 
337 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  43.61 
 
 
337 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.9 
 
 
344 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  45.64 
 
 
398 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  45.32 
 
 
356 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  43.08 
 
 
352 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  43.87 
 
 
365 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  43.08 
 
 
352 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  47.08 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  43.07 
 
 
371 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  44.34 
 
 
354 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  42.31 
 
 
354 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  46.83 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  40.8 
 
 
331 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  39.12 
 
 
343 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  47.08 
 
 
355 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>