More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3304 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  100 
 
 
344 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  95.64 
 
 
350 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  77.33 
 
 
345 aa  564  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  75.87 
 
 
344 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  65.31 
 
 
352 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  65.31 
 
 
352 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  67.48 
 
 
350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  63.88 
 
 
353 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  60.06 
 
 
356 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  60.06 
 
 
356 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  60.06 
 
 
356 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  60.12 
 
 
360 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  59.13 
 
 
353 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  57.02 
 
 
360 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  59.04 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  59.82 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  58.59 
 
 
345 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  57.14 
 
 
360 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  58.59 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  57.98 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  56.44 
 
 
370 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  55 
 
 
370 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  56.13 
 
 
345 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  54.68 
 
 
362 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  55.09 
 
 
353 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  53.85 
 
 
354 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  53.01 
 
 
348 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  53.25 
 
 
377 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  53.25 
 
 
377 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  51.62 
 
 
342 aa  362  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  52.96 
 
 
377 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  51.48 
 
 
343 aa  348  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  52.15 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  52.51 
 
 
336 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  49.26 
 
 
337 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.87 
 
 
370 aa  328  8e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  48.62 
 
 
371 aa  317  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  48.39 
 
 
363 aa  316  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  48.48 
 
 
365 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  49.85 
 
 
373 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  49.23 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  47.35 
 
 
368 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  46.95 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  46.93 
 
 
365 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  46.11 
 
 
337 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  46.97 
 
 
370 aa  300  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  45.03 
 
 
327 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  45.03 
 
 
327 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  45.48 
 
 
367 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  47.24 
 
 
369 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  46.42 
 
 
337 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  46.42 
 
 
337 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  46.42 
 
 
337 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  46.42 
 
 
337 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  44.68 
 
 
327 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.32 
 
 
370 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  47.71 
 
 
367 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  44.75 
 
 
327 aa  295  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  44.55 
 
 
359 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  44.92 
 
 
337 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  44.86 
 
 
337 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  46.79 
 
 
367 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  46.36 
 
 
348 aa  292  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  43.81 
 
 
345 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  46.39 
 
 
371 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  45.48 
 
 
355 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  44.62 
 
 
367 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  45.37 
 
 
340 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  45.76 
 
 
348 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  44.68 
 
 
339 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  45.76 
 
 
348 aa  289  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.08 
 
 
371 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  43.16 
 
 
368 aa  288  7e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  43.03 
 
 
360 aa  288  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  45.45 
 
 
348 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  46.63 
 
 
335 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  44.68 
 
 
339 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  44.92 
 
 
339 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  45.78 
 
 
371 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  45.59 
 
 
347 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  46.34 
 
 
320 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  44.68 
 
 
339 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  45.8 
 
 
371 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.41 
 
 
344 aa  285  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  43.49 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  44 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  43.16 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  42.86 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  44.17 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  47.85 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  43.36 
 
 
364 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  44.21 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  44.21 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  45.73 
 
 
321 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  43.4 
 
 
371 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  44.58 
 
 
320 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  44.58 
 
 
320 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  44.58 
 
 
320 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  44.58 
 
 
324 aa  278  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  44.71 
 
 
354 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>