More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2583 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  100 
 
 		 343 aa  712    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  68.31 
 
 		 354 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  70.88 
 
 		 377 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  70.88 
 
 		 377 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  71.47 
 
 		 377 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  65.99 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  63.82 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  52.82 
 
 		 353 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  52.16 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  52.34 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  51.48 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  50.59 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  51.48 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  50 
 
 		 350 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  50.15 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  50.29 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  49.11 
 
 		 360 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  50.29 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  48.25 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  48.25 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  48.25 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  49.41 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  48.5 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  50.6 
 
 		 342 aa  328  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  46.26 
 
 		 348 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  48.21 
 
 		 351 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  47.67 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  47.55 
 
 		 345 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  46.82 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  47.26 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  47.55 
 
 		 345 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  45.51 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  49.4 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.59 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46.5 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  46.71 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  47.81 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  47.19 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  45.29 
 
 		 360 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  45.14 
 
 		 327 aa  285  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  44.55 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  44.74 
 
 		 368 aa  282  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  44.83 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  42.39 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  44.83 
 
 		 327 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  43.96 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  44.51 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  47.4 
 
 		 370 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  44.34 
 
 		 378 aa  279  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  43.52 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  43.82 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  44.64 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  48.26 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  44.44 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  45.35 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  45.05 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  46.67 
 
 		 367 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  43.64 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  43.77 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  44.04 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  46.38 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  46.38 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  43.33 
 
 		 347 aa  272  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  45.05 
 
 		 370 aa  272  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  46.38 
 
 		 367 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  46.38 
 
 		 367 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  46.38 
 
 		 367 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  46.38 
 
 		 367 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  45.4 
 
 		 369 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  42.3 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  44.44 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  44.2 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  44.2 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  44.2 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  43.94 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  41.99 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  46.38 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  41.99 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  44.2 
 
 		 337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  45.71 
 
 		 367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  41.99 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  43.33 
 
 		 339 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  43.64 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  43.33 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  43.08 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  45.27 
 
 		 352 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  42.82 
 
 		 365 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  43.24 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  46.2 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  44.9 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  44.82 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  42.59 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  43.7 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  42.72 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  42.72 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  42.72 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  45.35 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  43.45 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  43.15 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  43.73 
 
 		 371 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>