More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0861 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  95.65 
 
 		 345 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  86.67 
 
 		 370 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  100 
 
 		 345 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  89.57 
 
 		 345 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  79.19 
 
 		 345 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  76.05 
 
 		 351 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  75.07 
 
 		 347 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  61.16 
 
 		 344 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  58.81 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  60.24 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  58.04 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  58.04 
 
 		 350 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  59.38 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  56.4 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  56.4 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  58.59 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  56.43 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  56.43 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  56.43 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  57.14 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  55.83 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  54.01 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  55.52 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  54.87 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  47.94 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  48.55 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  49.7 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  46.97 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  47.55 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  49.85 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.11 
 
 		 370 aa  315  6e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  46.76 
 
 		 377 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.77 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  46.18 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  46.18 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  47.2 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  47.66 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  44.44 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  50.92 
 
 		 331 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  47.73 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  45.54 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  48.62 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  47.01 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  48.41 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  47.34 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  47.34 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  47.06 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  44.48 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.71 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  46.65 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  46.45 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  44.81 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  44.81 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  44.81 
 
 		 348 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  45.62 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  47.34 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  43.64 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  44.81 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  46.22 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  44.48 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  44.48 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  45.62 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  44.95 
 
 		 335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  45.87 
 
 		 373 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  49.24 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  44.62 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  44.85 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  46.15 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  44.48 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  44.16 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  45.29 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  44.38 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  47.96 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  44.38 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  42.07 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  46.42 
 
 		 320 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  46.42 
 
 		 425 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  46.08 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  46.71 
 
 		 355 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  44.91 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  45.45 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  46.15 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  45.45 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  45.45 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  44 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  45.14 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  45.14 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  45.45 
 
 		 337 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  46.97 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  44.41 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  45.25 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  45.25 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  45.25 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  44.08 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  43.56 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  45.26 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  45.26 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  43.64 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.71 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  44.1 
 
 		 321 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>