More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2030 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  100 
 
 
342 aa  684    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  55.21 
 
 
352 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  55.21 
 
 
352 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  53.68 
 
 
350 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  53.19 
 
 
353 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  51.18 
 
 
350 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  51.62 
 
 
344 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  51.37 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  51.23 
 
 
344 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  52.73 
 
 
360 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  51.72 
 
 
353 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  52 
 
 
356 aa  348  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  52 
 
 
356 aa  348  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  52 
 
 
356 aa  348  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  50.75 
 
 
345 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  50.76 
 
 
370 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  51.37 
 
 
360 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  51.37 
 
 
360 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  49.69 
 
 
345 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  50 
 
 
345 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  50.31 
 
 
347 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  50 
 
 
345 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  49.08 
 
 
345 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  47.79 
 
 
348 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  51.06 
 
 
353 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  47.9 
 
 
354 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  47.15 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  50.6 
 
 
343 aa  328  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  46.04 
 
 
370 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  48.48 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  47.56 
 
 
377 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  47.56 
 
 
377 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  47.04 
 
 
354 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  46.38 
 
 
356 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  46.67 
 
 
356 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  46.38 
 
 
356 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  46.2 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  47.83 
 
 
367 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  47.83 
 
 
367 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  46.27 
 
 
320 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  46.27 
 
 
320 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  46.27 
 
 
320 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  47.83 
 
 
367 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  47.83 
 
 
367 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  47.83 
 
 
367 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  47.83 
 
 
367 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  47.83 
 
 
367 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  48.92 
 
 
331 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  47.58 
 
 
367 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  46.96 
 
 
354 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  46.06 
 
 
370 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  43.7 
 
 
367 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  48.12 
 
 
355 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  46.67 
 
 
354 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  44.24 
 
 
370 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  46.67 
 
 
354 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  45.71 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  46.69 
 
 
371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  49.85 
 
 
336 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  47.25 
 
 
354 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  47.25 
 
 
354 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  47.25 
 
 
355 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  41.3 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  43.43 
 
 
360 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  46.75 
 
 
352 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  46.75 
 
 
352 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  44.48 
 
 
368 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  46.85 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  41.28 
 
 
344 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  45.51 
 
 
337 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  45.51 
 
 
337 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  41.9 
 
 
348 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  45.48 
 
 
371 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  44.34 
 
 
337 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  43.81 
 
 
367 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  41.46 
 
 
348 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  43.98 
 
 
364 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  41.59 
 
 
348 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  41.46 
 
 
348 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  40.99 
 
 
321 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  44.91 
 
 
371 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  43.89 
 
 
425 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  43.75 
 
 
320 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  42.02 
 
 
327 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  40.85 
 
 
359 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  44.31 
 
 
371 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  44.61 
 
 
371 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  43.24 
 
 
367 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  40.12 
 
 
339 aa  258  8e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  42.4 
 
 
370 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  44.34 
 
 
320 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  41.74 
 
 
337 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  42.36 
 
 
369 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  43.43 
 
 
363 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  41.1 
 
 
339 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  41.1 
 
 
339 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  41.1 
 
 
339 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  45.57 
 
 
320 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  41.1 
 
 
347 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  41.99 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>