More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2057 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  100 
 
 
339 aa  704    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  83.19 
 
 
339 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  83.19 
 
 
339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  49.39 
 
 
348 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  48.64 
 
 
364 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  49.08 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  49.08 
 
 
348 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  48.77 
 
 
327 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  48.77 
 
 
348 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  50 
 
 
337 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  48.77 
 
 
331 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  51.54 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  48.77 
 
 
343 aa  318  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  49.38 
 
 
355 aa  318  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.87 
 
 
370 aa  318  9e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  45.78 
 
 
339 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  48.75 
 
 
327 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  46.25 
 
 
339 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  47.31 
 
 
378 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  47.62 
 
 
367 aa  315  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  46.25 
 
 
339 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  46.55 
 
 
367 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  47.34 
 
 
425 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  47.63 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  47.43 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  46.55 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46.32 
 
 
359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  45.71 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  48.12 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  48.12 
 
 
327 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  49.06 
 
 
327 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  47.37 
 
 
321 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  47.81 
 
 
320 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  45.65 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  47.81 
 
 
320 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  47.95 
 
 
320 aa  309  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  48.26 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  48.26 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  47.81 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  48.26 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  47.81 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  47.81 
 
 
320 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  46.77 
 
 
320 aa  308  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  45.32 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  47.85 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  47.68 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  46.91 
 
 
337 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  46.91 
 
 
337 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  44.92 
 
 
360 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  47.63 
 
 
320 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  47.89 
 
 
337 aa  305  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  47.63 
 
 
320 aa  305  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  47.63 
 
 
320 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  47.63 
 
 
320 aa  305  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  47.32 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  47.32 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  47.32 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  45.82 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  45.18 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  46.89 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  45.92 
 
 
368 aa  302  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  46.53 
 
 
356 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  47.62 
 
 
320 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  47 
 
 
320 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  46.25 
 
 
337 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  46.25 
 
 
337 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  43.37 
 
 
368 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  47.73 
 
 
355 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  46.22 
 
 
356 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  44.74 
 
 
373 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  46.77 
 
 
352 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  46.77 
 
 
352 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  46.69 
 
 
320 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  45.94 
 
 
337 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  45.94 
 
 
337 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  46.22 
 
 
356 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  45.87 
 
 
369 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.02 
 
 
354 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  45.65 
 
 
337 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  47.62 
 
 
320 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  46.53 
 
 
367 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  46.53 
 
 
367 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  45.2 
 
 
367 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  46.22 
 
 
367 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  46.53 
 
 
367 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  47.38 
 
 
398 aa  295  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  46.53 
 
 
367 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  46.53 
 
 
367 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  46.53 
 
 
367 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  46.53 
 
 
367 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  47.15 
 
 
370 aa  295  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  45.89 
 
 
320 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  43.58 
 
 
344 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  45.31 
 
 
340 aa  292  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  45.02 
 
 
354 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  45.02 
 
 
354 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  45.02 
 
 
370 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  45.02 
 
 
354 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  45.05 
 
 
365 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  45.02 
 
 
354 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>