More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2229 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  100 
 
 		 337 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  72.84 
 
 		 335 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  71 
 
 		 331 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  68.45 
 
 		 348 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  68.77 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  69.82 
 
 		 348 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  69.66 
 
 		 327 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  66.77 
 
 		 339 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  67.07 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  69.09 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  66.47 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  68.48 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  66.47 
 
 		 339 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  55.84 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  56.56 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  55.21 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  54.23 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  54.86 
 
 		 425 aa  360  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  50.31 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  52.29 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  54.72 
 
 		 320 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  54.72 
 
 		 320 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  54.72 
 
 		 320 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  56.25 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  55.7 
 
 		 320 aa  351  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  50.77 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  54.37 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  51.23 
 
 		 370 aa  344  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  48.94 
 
 		 370 aa  342  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  46.58 
 
 		 330 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  50 
 
 		 373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  51.83 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  50 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  50.15 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  51.4 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  47.73 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  48.77 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  46.43 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  48.46 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  48.02 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  50.61 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  49.7 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  47.31 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  47.01 
 
 		 356 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  47.68 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  47.68 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  48.33 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  49.85 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  49.85 
 
 		 352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  48.45 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  46.2 
 
 		 354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  50.63 
 
 		 320 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  48.02 
 
 		 356 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  50.63 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  50.63 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  48.36 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  48.32 
 
 		 368 aa  318  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  48.62 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  46.86 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  47.95 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  50.63 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  44.44 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  50.47 
 
 		 320 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  50.31 
 
 		 320 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  48.05 
 
 		 371 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  48.36 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  47.48 
 
 		 355 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  48.66 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  47.65 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  50.47 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  50.47 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  50.47 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  50.47 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  50.16 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  48.02 
 
 		 367 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  50.16 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  48.02 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  48.02 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  48.06 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  47.26 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  49.21 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  48.02 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  48.02 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  48.02 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  48.02 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  50.16 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  47.32 
 
 		 327 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  48.02 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  45.92 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  46.95 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  46.2 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  47 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  46.2 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  45.37 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  47 
 
 		 327 aa  305  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  46.2 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  45.9 
 
 		 354 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  47 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  49.09 
 
 		 371 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  46.81 
 
 		 354 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>