More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3141 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  100 
 
 
320 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  99.38 
 
 
320 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  100 
 
 
320 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  99.38 
 
 
320 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  99.06 
 
 
320 aa  656    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  662    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  98.75 
 
 
320 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  99.69 
 
 
320 aa  661    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  100 
 
 
320 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  89.38 
 
 
320 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  89.38 
 
 
320 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  89.38 
 
 
320 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  89.06 
 
 
320 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  89.06 
 
 
320 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  82.5 
 
 
320 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  70.66 
 
 
320 aa  477  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  71.29 
 
 
425 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  70.03 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  69.3 
 
 
320 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  67.72 
 
 
320 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  67.72 
 
 
320 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  67.72 
 
 
320 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  66.98 
 
 
320 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  60 
 
 
324 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  59.68 
 
 
320 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  57.46 
 
 
321 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  55.87 
 
 
348 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  56.19 
 
 
348 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  55.56 
 
 
348 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  55.24 
 
 
348 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  50.79 
 
 
359 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  51.75 
 
 
369 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  51.89 
 
 
322 aa  335  5.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  51.27 
 
 
364 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  53.65 
 
 
347 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  52.06 
 
 
339 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1047  ferrochelatase  51.09 
 
 
376 aa  331  8e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  52.7 
 
 
327 aa  331  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  50.16 
 
 
331 aa  331  9e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  49.84 
 
 
360 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  52.38 
 
 
339 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  52.38 
 
 
339 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  49.38 
 
 
327 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  49.84 
 
 
327 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  49.38 
 
 
327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  51.9 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  53.89 
 
 
328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  52.38 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  49.84 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  50.47 
 
 
370 aa  325  7e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  50.47 
 
 
337 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  50.47 
 
 
337 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  50.47 
 
 
337 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  50.47 
 
 
337 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  48.45 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  49.53 
 
 
337 aa  319  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  47.65 
 
 
339 aa  318  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  48.73 
 
 
337 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  48.59 
 
 
355 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  49.21 
 
 
340 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  47.58 
 
 
345 aa  316  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  47.02 
 
 
339 aa  315  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  48.35 
 
 
338 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  48.9 
 
 
339 aa  315  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  47.94 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  46.95 
 
 
343 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  50.47 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  47.32 
 
 
368 aa  309  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  48.12 
 
 
378 aa  308  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  48.26 
 
 
371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  46.63 
 
 
364 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  46.67 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  44.79 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3991  ferrochelatase  52.13 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.4603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  48.58 
 
 
352 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  47.34 
 
 
373 aa  298  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  48.26 
 
 
352 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  46.84 
 
 
368 aa  298  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  47.3 
 
 
337 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  47.3 
 
 
337 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  49.21 
 
 
365 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  46.25 
 
 
370 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  51.23 
 
 
371 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  47.53 
 
 
371 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  46.84 
 
 
344 aa  295  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.26 
 
 
370 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  47.04 
 
 
367 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  46.65 
 
 
371 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  46.79 
 
 
320 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  46.79 
 
 
320 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  46.95 
 
 
371 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.34 
 
 
371 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.96 
 
 
354 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  47.68 
 
 
335 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  45.85 
 
 
371 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  45.09 
 
 
364 aa  285  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  45.6 
 
 
352 aa  285  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  45.6 
 
 
352 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  45.25 
 
 
367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  46.27 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>