More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0179 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  100 
 
 
337 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  100 
 
 
337 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  57.41 
 
 
352 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  57.41 
 
 
352 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  52.47 
 
 
369 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  53.92 
 
 
371 aa  364  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  53.23 
 
 
370 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  54.63 
 
 
368 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  55.41 
 
 
367 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  54.21 
 
 
367 aa  358  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  54.79 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  55.11 
 
 
363 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  51.86 
 
 
369 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  53.05 
 
 
368 aa  352  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  53.11 
 
 
344 aa  352  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  52.01 
 
 
373 aa  352  7e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  52.6 
 
 
364 aa  351  8e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  52.66 
 
 
337 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  55.86 
 
 
354 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  51.54 
 
 
327 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  51.07 
 
 
348 aa  348  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  52.63 
 
 
365 aa  348  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  52.02 
 
 
327 aa  348  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  52.42 
 
 
367 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  52.05 
 
 
355 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  51.72 
 
 
327 aa  345  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  54.14 
 
 
367 aa  345  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  50.46 
 
 
339 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  50.46 
 
 
339 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  50.15 
 
 
348 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  50.46 
 
 
348 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  49.85 
 
 
339 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  50.46 
 
 
335 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  51.1 
 
 
327 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  51.1 
 
 
327 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  50.31 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  51.55 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  50.94 
 
 
337 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  50.94 
 
 
337 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  48 
 
 
360 aa  342  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  49.54 
 
 
345 aa  342  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  52.8 
 
 
365 aa  341  9e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  50.62 
 
 
337 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  52.44 
 
 
338 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  46.44 
 
 
359 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  50.15 
 
 
348 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  50.62 
 
 
337 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  50.15 
 
 
339 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  49.69 
 
 
337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.66 
 
 
370 aa  338  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  48.46 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  48.3 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  52.83 
 
 
325 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  48.76 
 
 
354 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  50.61 
 
 
371 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  50 
 
 
340 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  48.65 
 
 
378 aa  333  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  50.91 
 
 
371 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  54.21 
 
 
398 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  51.52 
 
 
371 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  48.59 
 
 
324 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  48.75 
 
 
337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  50.91 
 
 
371 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  51.21 
 
 
371 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  48.78 
 
 
356 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  55.14 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  51.08 
 
 
328 aa  325  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  50.46 
 
 
364 aa  325  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  47.26 
 
 
354 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  48.89 
 
 
320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  48.89 
 
 
425 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  47.62 
 
 
320 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  50.77 
 
 
371 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  46.95 
 
 
356 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  47.94 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  47.94 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  47.94 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  47.94 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  47.94 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  47.94 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  47.94 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  49.01 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  46.65 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  43.79 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  47.94 
 
 
320 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  46.98 
 
 
320 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  46.98 
 
 
320 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  46.98 
 
 
320 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  48.24 
 
 
355 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  48.73 
 
 
320 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  47.84 
 
 
339 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  46.91 
 
 
339 aa  306  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  46.91 
 
 
339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  47.68 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  47.26 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  46.95 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  46.65 
 
 
354 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  47.26 
 
 
355 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  47.4 
 
 
354 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  47.4 
 
 
354 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>