More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1864 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  100 
 
 		 378 aa  788    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  63.41 
 
 		 370 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  58.74 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  57.14 
 
 		 359 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  57.51 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  57.18 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  55.37 
 
 		 369 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  53.58 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  55.21 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  55.21 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  55.21 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  55.21 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  56.85 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  49.33 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  54.6 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  54.6 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  54.6 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  54.6 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  54.6 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  53.89 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  53.44 
 
 		 340 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  52.58 
 
 		 337 aa  358  8e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  51.53 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  51.04 
 
 		 345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  55.99 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  52.6 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  51.05 
 
 		 343 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  51.23 
 
 		 355 aa  348  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  48.94 
 
 		 331 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  50.76 
 
 		 348 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  49.54 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  50.46 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  50.46 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  50.15 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  48.51 
 
 		 367 aa  338  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  52.58 
 
 		 370 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  49.3 
 
 		 368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48.63 
 
 		 347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  48.33 
 
 		 339 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  48.09 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  48.65 
 
 		 337 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  48.33 
 
 		 339 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  48.65 
 
 		 337 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  48.33 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  50.15 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  51.06 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  49.4 
 
 		 338 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  47.73 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  51.06 
 
 		 352 aa  328  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  48.2 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  51.41 
 
 		 320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  48.69 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  51.41 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  47.72 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  49.06 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  51.1 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  51.1 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  50.47 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  51.1 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  46.44 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  51.51 
 
 		 328 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  50.47 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  49.43 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  48 
 
 		 367 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  47.88 
 
 		 344 aa  318  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  45.58 
 
 		 371 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  46.36 
 
 		 339 aa  317  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  46.95 
 
 		 362 aa  316  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  47.31 
 
 		 339 aa  316  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  50.31 
 
 		 320 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  48.17 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  46.06 
 
 		 339 aa  315  9e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  50.94 
 
 		 320 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  47.73 
 
 		 337 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  49.38 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  50 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  48.51 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  45.19 
 
 		 371 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  45.86 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  45.77 
 
 		 371 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  45.19 
 
 		 371 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  47.85 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  46.65 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  52.12 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  46.95 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  46.97 
 
 		 345 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  48.59 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  48.59 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  48.59 
 
 		 320 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  48.59 
 
 		 320 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  46.36 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  46.95 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  48.59 
 
 		 320 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  48.44 
 
 		 320 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  48.44 
 
 		 320 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  48.44 
 
 		 320 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  48.44 
 
 		 320 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  45.73 
 
 		 360 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  45.12 
 
 		 356 aa  301  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  46.41 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>