More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3498 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  100 
 
 
362 aa  759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  85.38 
 
 
370 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  74.57 
 
 
354 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  74.56 
 
 
377 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  74.56 
 
 
377 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  74.56 
 
 
377 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  65.99 
 
 
343 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  55.72 
 
 
356 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  56.01 
 
 
344 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  55.72 
 
 
356 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  54.52 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  54.78 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  53.69 
 
 
350 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  53.09 
 
 
360 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  53.09 
 
 
360 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  54.76 
 
 
345 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  54.68 
 
 
344 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  53.06 
 
 
353 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  51.93 
 
 
353 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  49.58 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  49.58 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  49.71 
 
 
350 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  48.8 
 
 
353 aa  346  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  48.22 
 
 
348 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  50.3 
 
 
345 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  49.1 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  48.78 
 
 
347 aa  339  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  48.48 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  48.48 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  48.17 
 
 
345 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  47.56 
 
 
370 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.59 
 
 
370 aa  329  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  47.15 
 
 
342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.31 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  48.93 
 
 
359 aa  326  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  49.23 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  48.13 
 
 
371 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  46.95 
 
 
378 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  49.27 
 
 
336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  49.85 
 
 
370 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  47.38 
 
 
355 aa  309  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  46.46 
 
 
337 aa  309  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  44.18 
 
 
368 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  48 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  48.16 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  46.48 
 
 
373 aa  305  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  45.87 
 
 
348 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  46.15 
 
 
331 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  46.04 
 
 
347 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  47.56 
 
 
331 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  45.71 
 
 
348 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  45.54 
 
 
339 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  45.71 
 
 
348 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  45.71 
 
 
348 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  46.27 
 
 
337 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  45.12 
 
 
364 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  46.77 
 
 
327 aa  299  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  45.54 
 
 
339 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  45.54 
 
 
339 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  46.55 
 
 
371 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  46.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  46.46 
 
 
327 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  45.15 
 
 
354 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  43.86 
 
 
343 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  46.48 
 
 
321 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  46.46 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  47.22 
 
 
320 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.11 
 
 
371 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  45.05 
 
 
371 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  46.11 
 
 
371 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  46.91 
 
 
337 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  46.91 
 
 
337 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  46.91 
 
 
337 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  46.91 
 
 
337 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  45.23 
 
 
339 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  44.28 
 
 
345 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  46.46 
 
 
320 aa  291  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  46.46 
 
 
320 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  46.46 
 
 
320 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  44.24 
 
 
330 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  45.9 
 
 
365 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  46.2 
 
 
337 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  44.41 
 
 
337 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.18 
 
 
354 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  45.35 
 
 
371 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  44.95 
 
 
340 aa  288  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  46.79 
 
 
367 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  49.55 
 
 
371 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  45.24 
 
 
368 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  45.4 
 
 
335 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  44.71 
 
 
352 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  44.95 
 
 
363 aa  286  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  44.74 
 
 
356 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  44.71 
 
 
352 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  43.95 
 
 
364 aa  285  9e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  42.94 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  44.74 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  43.94 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  44.74 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  44.74 
 
 
356 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>