More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1081 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  100 
 
 		 425 aa  879    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  98.12 
 
 		 320 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  82.19 
 
 		 320 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  77.36 
 
 		 320 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  77.53 
 
 		 320 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  77.53 
 
 		 320 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  77.53 
 
 		 320 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  78.12 
 
 		 320 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  71.92 
 
 		 320 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  71.92 
 
 		 320 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  72.24 
 
 		 320 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  71.92 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  71.61 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  69.72 
 
 		 320 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  71.29 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  71.29 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  71.29 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  71.29 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  70.98 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  70.66 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  70.66 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  70.66 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  70.03 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  61.99 
 
 		 324 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  59.68 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  58.81 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  58.49 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  58.41 
 
 		 321 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  58.49 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  58.49 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  54.72 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  55.66 
 
 		 347 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  54.72 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  54.72 
 
 		 339 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  54.4 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  54.4 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  54.09 
 
 		 335 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  53.61 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  52.17 
 
 		 370 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  50.94 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  54.86 
 
 		 337 aa  342  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  50.94 
 
 		 331 aa  341  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  49.25 
 
 		 343 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  51.58 
 
 		 327 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  48.96 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  50.94 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  50.78 
 
 		 327 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  51.1 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  47.63 
 
 		 355 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  49.22 
 
 		 354 aa  331  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  49.53 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.47 
 
 		 337 aa  331  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  50.47 
 
 		 327 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  52.94 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  51.26 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  51.41 
 
 		 378 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  48.62 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  49.53 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  50.31 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  49.53 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  49.22 
 
 		 337 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  49.22 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1047  ferrochelatase  49.06 
 
 		 376 aa  322  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  49.68 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  49.69 
 
 		 330 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  48.48 
 
 		 338 aa  319  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  48.89 
 
 		 337 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  48.89 
 
 		 337 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  48.57 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  48.77 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  48.92 
 
 		 352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  50 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  47.34 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  49.84 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  47.44 
 
 		 325 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  50.47 
 
 		 370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  46.37 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  46.37 
 
 		 339 aa  307  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  47.35 
 
 		 373 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  47.44 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  47.44 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  48.23 
 
 		 370 aa  297  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  47.84 
 
 		 335 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  47.96 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  46.56 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  47.53 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  46.33 
 
 		 367 aa  292  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  46.63 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  46.63 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  47.06 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  45.9 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  46.01 
 
 		 364 aa  289  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  46.6 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  46.44 
 
 		 356 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  44.94 
 
 		 367 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  44.03 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  48.9 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3991  ferrochelatase  48.68 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.4603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  46.47 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  48.3 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>