More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0045 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  100 
 
 
370 aa  766    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  63.41 
 
 
378 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  61.83 
 
 
364 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  61.35 
 
 
371 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  60.81 
 
 
369 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  60.39 
 
 
373 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  54.59 
 
 
359 aa  438  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  59.53 
 
 
370 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  54.84 
 
 
360 aa  418  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  53.64 
 
 
368 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  55.49 
 
 
337 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  54.02 
 
 
363 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  54.6 
 
 
327 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  54.6 
 
 
337 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  53.78 
 
 
343 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  54.29 
 
 
327 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  54.29 
 
 
327 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  54.27 
 
 
327 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  53.96 
 
 
365 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  54.91 
 
 
337 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  52.25 
 
 
345 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  52.86 
 
 
368 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  53.82 
 
 
337 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  53.77 
 
 
354 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  54.83 
 
 
340 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  51.34 
 
 
367 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  52.7 
 
 
367 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  53.82 
 
 
337 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  53.52 
 
 
337 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  52.76 
 
 
355 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  53.52 
 
 
337 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  50.27 
 
 
367 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  52.03 
 
 
365 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  53.23 
 
 
337 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  55.25 
 
 
325 aa  364  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  53.23 
 
 
337 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  51.58 
 
 
367 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  51.44 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  53.68 
 
 
348 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  53.49 
 
 
370 aa  360  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  56.16 
 
 
371 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  50.72 
 
 
369 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  50.61 
 
 
335 aa  358  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  52 
 
 
327 aa  358  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  52.92 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  51.83 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  53.05 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  53.07 
 
 
348 aa  356  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  53.07 
 
 
348 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  50.89 
 
 
338 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  52 
 
 
339 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  51.22 
 
 
356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  51.22 
 
 
356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  52.76 
 
 
348 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  54.55 
 
 
328 aa  352  8e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  47.47 
 
 
371 aa  352  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  52 
 
 
339 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  52.31 
 
 
339 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  50.57 
 
 
364 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  52 
 
 
339 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  50 
 
 
371 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  49.09 
 
 
331 aa  349  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  52.8 
 
 
320 aa  348  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  50.57 
 
 
371 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  52.17 
 
 
425 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  50 
 
 
371 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  52.81 
 
 
320 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  49.85 
 
 
360 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  49.41 
 
 
344 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  51.56 
 
 
320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  51.56 
 
 
320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  51.56 
 
 
320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  49.56 
 
 
360 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  52.44 
 
 
352 aa  342  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  52.44 
 
 
352 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  49.55 
 
 
353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  48.66 
 
 
348 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  52.65 
 
 
398 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  46.86 
 
 
370 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  49.09 
 
 
344 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  48.84 
 
 
354 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  49.86 
 
 
364 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  47.59 
 
 
362 aa  329  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  48.17 
 
 
350 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  51.26 
 
 
320 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  47.87 
 
 
344 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  51.26 
 
 
320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  48.04 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  51.26 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  51.26 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  47.37 
 
 
345 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  48.52 
 
 
353 aa  326  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  48.94 
 
 
337 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  51.26 
 
 
320 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  51.34 
 
 
356 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  48.5 
 
 
345 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  48.33 
 
 
345 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  48.48 
 
 
339 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  48.17 
 
 
339 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  49.07 
 
 
321 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>