295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3336 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  100 
 
 
337 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  66.05 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  63.47 
 
 
336 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  55.93 
 
 
368 aa  345  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  51.04 
 
 
345 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  50.6 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  50.89 
 
 
360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  49.56 
 
 
350 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  49.26 
 
 
344 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  49.7 
 
 
356 aa  338  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  49.7 
 
 
356 aa  338  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  50.15 
 
 
360 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  49.4 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  49.7 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  49.56 
 
 
353 aa  328  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  50.44 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  52.42 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  51.08 
 
 
367 aa  325  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  52.89 
 
 
363 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  48.38 
 
 
353 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  50.91 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  46.57 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  46.57 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  47.26 
 
 
350 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.78 
 
 
337 aa  317  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  46.18 
 
 
370 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  49.1 
 
 
367 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  46.76 
 
 
348 aa  315  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  48.48 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  51.55 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  47.6 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  51.23 
 
 
367 aa  311  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  48.62 
 
 
359 aa  311  6.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  50.46 
 
 
327 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  50.46 
 
 
327 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  50.16 
 
 
327 aa  309  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  45.29 
 
 
362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  47.87 
 
 
347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  50.78 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  50.91 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  48.48 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  50 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  49.7 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  50.78 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  50.78 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  50.78 
 
 
337 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  50.47 
 
 
355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  45.26 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  47.55 
 
 
369 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  49.53 
 
 
337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  47.56 
 
 
370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  44.41 
 
 
354 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  49.4 
 
 
354 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  46.65 
 
 
345 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  48.47 
 
 
352 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  46.65 
 
 
345 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  48.47 
 
 
352 aa  298  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  47.13 
 
 
370 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  49.54 
 
 
373 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  47.72 
 
 
345 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  47.4 
 
 
367 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  47.38 
 
 
327 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  46.18 
 
 
377 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  50 
 
 
398 aa  292  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  46.18 
 
 
377 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  47.48 
 
 
354 aa  292  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  47.4 
 
 
343 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  44.12 
 
 
343 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  48.77 
 
 
354 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  48.5 
 
 
371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  47.01 
 
 
371 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  48.2 
 
 
371 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  45.73 
 
 
364 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  47.01 
 
 
371 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  46.65 
 
 
377 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  47.13 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  45.68 
 
 
340 aa  282  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  49.35 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  49.35 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  47.9 
 
 
371 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  46.95 
 
 
371 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  45.77 
 
 
356 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  47.27 
 
 
370 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  47.24 
 
 
369 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  44.34 
 
 
342 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  45.48 
 
 
356 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  44.17 
 
 
335 aa  278  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  46.97 
 
 
356 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  42.6 
 
 
331 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  44.97 
 
 
364 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  43.84 
 
 
368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  44.48 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  44.48 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  44.28 
 
 
348 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  44.17 
 
 
348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  43.08 
 
 
339 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  44.51 
 
 
337 aa  271  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  43.08 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  43.08 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  44 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>