More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2691 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  100 
 
 		 345 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  80.23 
 
 		 344 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  77.33 
 
 		 344 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  77.03 
 
 		 350 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  67.57 
 
 		 352 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  67.57 
 
 		 352 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  67.79 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  65.88 
 
 		 353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  63.58 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  60.9 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  60.78 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  60.48 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  58.68 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  60.48 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  61.14 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  58.51 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  60.74 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  59.82 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  59.27 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  59.51 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  59.2 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  58.9 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  56.73 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  58.98 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  54.76 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  54.28 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  54.44 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  52.16 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  53.1 
 
 		 377 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  53.1 
 
 		 377 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  53.12 
 
 		 377 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  53.68 
 
 		 331 aa  345  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  50.75 
 
 		 342 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  54.79 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  51.04 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.37 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  50.88 
 
 		 363 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  50 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  49.56 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  51.06 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  50 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  45.88 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  50.46 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  46.18 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  46.56 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  45.29 
 
 		 360 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  47.55 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  46.11 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  47.29 
 
 		 371 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  47.55 
 
 		 369 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  45.2 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  46.2 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  45.64 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  45 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  45 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  46.99 
 
 		 371 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  44.38 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  45.77 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.88 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  43.73 
 
 		 340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  47.71 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  45.17 
 
 		 337 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  46.69 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  45.73 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  47.38 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  44.88 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  44.38 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  43.27 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  45.73 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  44.38 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  43.9 
 
 		 368 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  44.38 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  44.06 
 
 		 337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  46.32 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  44.57 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  44.25 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  46.11 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  46.38 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  45.71 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  48.49 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  46.18 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  44.89 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  43.96 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  48.04 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  45.45 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  48.04 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  48.04 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  48.04 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  48.04 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  48.04 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  44.11 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  48.04 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  42.55 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  45.62 
 
 		 356 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  45.51 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  43.69 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  43.56 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  44.79 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  44.79 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  45.87 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>