More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3712 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  100 
 
 
344 aa  720    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  80.23 
 
 
345 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  76.74 
 
 
350 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  75.87 
 
 
344 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  68.77 
 
 
352 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  68.77 
 
 
352 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  67.44 
 
 
350 aa  484  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  67.16 
 
 
353 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  62.5 
 
 
360 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  63.8 
 
 
356 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  63.8 
 
 
356 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  63.19 
 
 
353 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  63.5 
 
 
356 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  61.31 
 
 
360 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  61.72 
 
 
360 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  62.88 
 
 
345 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  61.96 
 
 
345 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  61.36 
 
 
351 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  61.04 
 
 
345 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  59.82 
 
 
370 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  60.43 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  59.51 
 
 
345 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  56.01 
 
 
362 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  57.06 
 
 
370 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  55.92 
 
 
348 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  54.84 
 
 
354 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  55.69 
 
 
353 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  55.88 
 
 
377 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  55.88 
 
 
377 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  54.68 
 
 
377 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  51.23 
 
 
342 aa  355  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  52.34 
 
 
343 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  54.29 
 
 
331 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  49.09 
 
 
370 aa  333  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  51.23 
 
 
368 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  52.82 
 
 
336 aa  328  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  51.36 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  49.7 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  50 
 
 
365 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  50.92 
 
 
363 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  50 
 
 
369 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  47.37 
 
 
364 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.48 
 
 
360 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  49.24 
 
 
373 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.62 
 
 
370 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  48.77 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  47.66 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  47.04 
 
 
337 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  46.3 
 
 
340 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  46.42 
 
 
327 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  46.42 
 
 
327 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  48.05 
 
 
371 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  46.65 
 
 
364 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  42.69 
 
 
368 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  47.94 
 
 
364 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  45.99 
 
 
327 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  47.06 
 
 
367 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  47.75 
 
 
371 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  46.08 
 
 
367 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  45.43 
 
 
359 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  46.08 
 
 
367 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  46.11 
 
 
337 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  46.11 
 
 
337 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  47.45 
 
 
371 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  45.79 
 
 
337 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  46.32 
 
 
352 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  46.97 
 
 
370 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  46.25 
 
 
371 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  46.32 
 
 
352 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  47.4 
 
 
321 aa  292  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  46.32 
 
 
324 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  46.77 
 
 
327 aa  291  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  45.79 
 
 
337 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  45.79 
 
 
337 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  45.48 
 
 
337 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  45.06 
 
 
354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  46.95 
 
 
378 aa  289  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  47.46 
 
 
356 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  47.29 
 
 
356 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  45.79 
 
 
355 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  44.48 
 
 
369 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  47.17 
 
 
320 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  45.71 
 
 
337 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  45.71 
 
 
337 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  46.67 
 
 
356 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  46.13 
 
 
367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  43.47 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  46.27 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  48.66 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.62 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  44.44 
 
 
371 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  47.85 
 
 
398 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  44.31 
 
 
331 aa  281  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  49.7 
 
 
371 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  45.14 
 
 
320 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  45.71 
 
 
348 aa  278  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  43.12 
 
 
343 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  43.34 
 
 
320 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  43.34 
 
 
320 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  45 
 
 
320 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>