274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  98.24 
 
 
340 aa  678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  100 
 
 
340 aa  688    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  72.22 
 
 
340 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  70.12 
 
 
341 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  69.25 
 
 
340 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  66.77 
 
 
338 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  67.76 
 
 
340 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  68.75 
 
 
337 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  67.26 
 
 
337 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  66.47 
 
 
338 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  70.27 
 
 
338 aa  471  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  48.64 
 
 
342 aa  328  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  46.18 
 
 
337 aa  312  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  48.34 
 
 
343 aa  309  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  45.05 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  47.01 
 
 
345 aa  286  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  44.81 
 
 
354 aa  275  8e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  46.04 
 
 
357 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  44.51 
 
 
341 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  43.53 
 
 
352 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  43.53 
 
 
352 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  44.28 
 
 
368 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  41.07 
 
 
331 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  38.71 
 
 
344 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  38.96 
 
 
331 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  42.86 
 
 
327 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  39.01 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  39.6 
 
 
371 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  40.52 
 
 
371 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  40.8 
 
 
371 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  41.72 
 
 
369 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  41.67 
 
 
371 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  41.86 
 
 
367 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  41.86 
 
 
367 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  41.86 
 
 
367 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  41.86 
 
 
367 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  41.24 
 
 
335 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  41.86 
 
 
367 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  41.86 
 
 
367 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  40.95 
 
 
371 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  40 
 
 
354 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  41.23 
 
 
347 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  41.86 
 
 
367 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  39.23 
 
 
367 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  42.06 
 
 
355 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  40.18 
 
 
335 aa  235  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  39.41 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  40.52 
 
 
371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  39.53 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  39.53 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  40.88 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  40.59 
 
 
365 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  40 
 
 
364 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  38.81 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  40.48 
 
 
337 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  41.86 
 
 
355 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  37.57 
 
 
344 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  40.59 
 
 
354 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  38.11 
 
 
364 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  40.29 
 
 
354 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  41.4 
 
 
354 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  39.69 
 
 
339 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  39.12 
 
 
356 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  40.76 
 
 
356 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  41.4 
 
 
354 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  40.99 
 
 
354 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  36.61 
 
 
357 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  40 
 
 
339 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  40 
 
 
339 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  39.23 
 
 
369 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  38.82 
 
 
356 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  38.08 
 
 
367 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  39.7 
 
 
370 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  37.9 
 
 
348 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  41.21 
 
 
336 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  41.81 
 
 
354 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  39.69 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  37.61 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  37.61 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  35.45 
 
 
337 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  37.01 
 
 
327 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  37.32 
 
 
370 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  37.01 
 
 
327 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  39.05 
 
 
367 aa  219  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  36.2 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  35.31 
 
 
353 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  36.42 
 
 
355 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  36.72 
 
 
327 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  36.58 
 
 
362 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  38.46 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  38.46 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  38.21 
 
 
348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  36.63 
 
 
337 aa  215  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  41.74 
 
 
331 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  38.22 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  38.01 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  36.07 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  36.87 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  36.69 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  36.07 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>