294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6498 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  100 
 
 
342 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  51.98 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  50.45 
 
 
354 aa  353  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  50.6 
 
 
337 aa  352  5e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  50 
 
 
340 aa  351  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  49.55 
 
 
341 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  49.85 
 
 
338 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  49.39 
 
 
338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  48.2 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  47.76 
 
 
338 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  49.09 
 
 
340 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  48.64 
 
 
340 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  49.39 
 
 
340 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  48.64 
 
 
340 aa  331  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  48.37 
 
 
343 aa  324  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  47.95 
 
 
345 aa  322  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_002950  PG0127  ferrochelatase  43.29 
 
 
345 aa  293  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  42.04 
 
 
357 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  41.27 
 
 
354 aa  272  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  43.24 
 
 
344 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  40.71 
 
 
341 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  41.96 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  40.84 
 
 
353 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  42.51 
 
 
320 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  43.12 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  40.91 
 
 
331 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  40.91 
 
 
331 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  40.74 
 
 
321 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  40.49 
 
 
364 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  40.81 
 
 
324 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  39.4 
 
 
368 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  40.37 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  39.64 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  38.02 
 
 
327 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  39.05 
 
 
330 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  38.84 
 
 
347 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  37.99 
 
 
337 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  38.23 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  40.49 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  38.37 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  38.21 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  37.76 
 
 
425 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  38.23 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  38.58 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  38.23 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  38.37 
 
 
327 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  38.1 
 
 
320 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  37.16 
 
 
320 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  38.97 
 
 
337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  38.1 
 
 
320 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  37.03 
 
 
352 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  38.97 
 
 
337 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  38.1 
 
 
320 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  38.1 
 
 
320 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  38.97 
 
 
337 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  37.32 
 
 
352 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  39.71 
 
 
371 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  37.46 
 
 
327 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  38.97 
 
 
337 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  39.7 
 
 
371 aa  230  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  37.99 
 
 
370 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  37.92 
 
 
339 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  38.1 
 
 
320 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  39.42 
 
 
371 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  36.47 
 
 
367 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  37.92 
 
 
348 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  36.81 
 
 
355 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  36.87 
 
 
338 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  37.61 
 
 
348 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  35.88 
 
 
360 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  39.02 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  39.33 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  37.61 
 
 
348 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  38.34 
 
 
373 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  36.36 
 
 
345 aa  225  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  38.62 
 
 
369 aa  225  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  37.35 
 
 
320 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  36.09 
 
 
337 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  36.42 
 
 
337 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  36.09 
 
 
337 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  37.23 
 
 
320 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  37.23 
 
 
320 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  37.23 
 
 
320 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  38.72 
 
 
320 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  36.66 
 
 
320 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  37.65 
 
 
354 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1047  ferrochelatase  39.2 
 
 
376 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  38.75 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  37.39 
 
 
369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  38.41 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  38.72 
 
 
320 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  38.72 
 
 
320 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  38.72 
 
 
320 aa  222  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  38.72 
 
 
320 aa  222  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  38.55 
 
 
371 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  36.78 
 
 
367 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  38.41 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  38.41 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  37.76 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  38.15 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>