290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2470 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  100 
 
 
345 aa  711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  47.95 
 
 
342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  45.88 
 
 
354 aa  326  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  46.29 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  48.06 
 
 
341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  46.87 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  48.18 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  47.16 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  47.6 
 
 
340 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  47.01 
 
 
340 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  45.83 
 
 
338 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  45.11 
 
 
343 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  46.29 
 
 
340 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  47.79 
 
 
338 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  45.7 
 
 
340 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  45.24 
 
 
338 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  44.68 
 
 
357 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  42.43 
 
 
344 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  41.45 
 
 
344 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  39.59 
 
 
354 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  40.3 
 
 
353 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  39.3 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  39.88 
 
 
357 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  41.03 
 
 
331 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  40.48 
 
 
331 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  41.12 
 
 
320 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  40.83 
 
 
425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0127  ferrochelatase  41.69 
 
 
345 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  40.83 
 
 
367 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  39.36 
 
 
335 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  38.92 
 
 
320 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  38.92 
 
 
320 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  39.59 
 
 
320 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  38.92 
 
 
320 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  38.92 
 
 
320 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  39.94 
 
 
368 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  38.92 
 
 
320 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  40.06 
 
 
364 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  39.71 
 
 
347 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  38.42 
 
 
321 aa  225  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  40.88 
 
 
320 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  39 
 
 
327 aa  225  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  39.94 
 
 
371 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  39.88 
 
 
320 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  40.29 
 
 
344 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  39.66 
 
 
371 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  39.66 
 
 
371 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  40.36 
 
 
363 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  37.35 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  37.57 
 
 
331 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  37.98 
 
 
367 aa  222  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  39.77 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  37.85 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  38.37 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  38.76 
 
 
320 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  39.05 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  39.36 
 
 
355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  39.05 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  39.05 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  38.24 
 
 
348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  39.05 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  41.02 
 
 
320 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  39.05 
 
 
320 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  38.24 
 
 
348 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  38.62 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  40.23 
 
 
345 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  39.3 
 
 
337 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  38.37 
 
 
339 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  38.37 
 
 
339 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  38.76 
 
 
320 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  38.76 
 
 
320 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  40.57 
 
 
365 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  38.37 
 
 
348 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  37.75 
 
 
371 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  38.46 
 
 
320 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  38.97 
 
 
350 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  37.32 
 
 
354 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  37.11 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  37.43 
 
 
320 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  37.43 
 
 
320 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  37.43 
 
 
320 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  38.08 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  37.71 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  37.69 
 
 
354 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  37.79 
 
 
337 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  36.54 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  37.43 
 
 
370 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  38.51 
 
 
351 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  39.66 
 
 
350 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  37.64 
 
 
345 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  38.76 
 
 
352 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  37.79 
 
 
337 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  37.28 
 
 
327 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  37.03 
 
 
373 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  38.12 
 
 
371 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  38.76 
 
 
352 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  36.1 
 
 
368 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  38.12 
 
 
337 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  37.61 
 
 
369 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  38.3 
 
 
370 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>