More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4417 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  100 
 
 		 357 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  70.9 
 
 		 353 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  62.02 
 
 		 344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  51.18 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  46.31 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  43.11 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  42.18 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  43.84 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  43.84 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  41.87 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  42.56 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  42.9 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  43.12 
 
 		 342 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  40.83 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  38.28 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  38.28 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  39.05 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  39.17 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  37.79 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  36.42 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  38.58 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  39.05 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  38.15 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  36.92 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  37.61 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  38.28 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  38.15 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  37.03 
 
 		 321 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  38.04 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  35.99 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  36.09 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  37.46 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  36.69 
 
 		 355 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  36.87 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  36.96 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  36.87 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  38.6 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  35.78 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  35.92 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  37.76 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  36.31 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  37.13 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  37.8 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  37.5 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  34.3 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  35.09 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  35.5 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  39.88 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  35.84 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  37.54 
 
 		 378 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  34.39 
 
 		 345 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  35.8 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  36.99 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  36.44 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  36.52 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  37.17 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  34.91 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  34.91 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  35.21 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  36.9 
 
 		 340 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  35.1 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  35.1 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  35.1 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  36.31 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  36.89 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  35.82 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  33.81 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  34.62 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  36.61 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  34.62 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  34.62 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  34.62 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  32.65 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  32.47 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  36.76 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  36.76 
 
 		 320 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  36.76 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  36.76 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  35.51 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  35.51 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  34.93 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  34.23 
 
 		 320 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  36.9 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  36.76 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  35.76 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  35.23 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  35.63 
 
 		 320 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  36.28 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  35.23 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  35.47 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  35.65 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  34.1 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  34.1 
 
 		 354 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  36.36 
 
 		 335 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  34.97 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  35.48 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  33.24 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  33.81 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  34.11 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  35.33 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>