284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0744 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  100 
 
 		 338 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  96.15 
 
 		 338 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  90.83 
 
 		 337 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  89.05 
 
 		 337 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  75.15 
 
 		 341 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  74.85 
 
 		 340 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  75.15 
 
 		 340 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  74.26 
 
 		 340 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  68.96 
 
 		 338 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  66.47 
 
 		 340 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  66.77 
 
 		 340 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  49.85 
 
 		 342 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  44.94 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  45.32 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  45.02 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  45.24 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  45.83 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  41.64 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  39.29 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  41.94 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  39.88 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  38.82 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  39.47 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  41.64 
 
 		 368 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  39.77 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  39.77 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  37.5 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  37.61 
 
 		 367 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  37.54 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  39.53 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  37.61 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  38.71 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  39.82 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  38.6 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  38.66 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  38.66 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  38.46 
 
 		 348 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  39.64 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  38.46 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  38.17 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  39.64 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  39.64 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  38.37 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  37.32 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  37.36 
 
 		 371 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0127  ferrochelatase  37.61 
 
 		 345 aa  232  9e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  37.64 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  37.57 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  37.25 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  38.3 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  39.03 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  36.76 
 
 		 369 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  35.29 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  38.42 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  35.96 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  39.05 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  39.07 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  38.66 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  36.76 
 
 		 369 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  35.91 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  34.87 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  38.24 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  38.84 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  38.84 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  38.84 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  38.84 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  38.73 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  38.73 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  38.35 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  35.19 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  37.98 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  38.73 
 
 		 367 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  39.47 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  38.37 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  35.8 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  37.98 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  36.13 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  38.68 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  37.46 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  34.8 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  37.09 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  35.29 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  35 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  36.57 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  37.72 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  38.73 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  41.67 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  36.36 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  35.17 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  35.96 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  41.23 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  34.97 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  37.17 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  37.61 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  35.67 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  35.67 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  35.36 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  37.32 
 
 		 353 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  34.31 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  37.54 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>