274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4445 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  100 
 
 		 337 aa  690    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  89.61 
 
 		 337 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  90.83 
 
 		 338 aa  630  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  89.05 
 
 		 338 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  78.04 
 
 		 341 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  76.85 
 
 		 340 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  77.15 
 
 		 340 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  76.56 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  70.06 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  68.75 
 
 		 340 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  68.15 
 
 		 340 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  48.2 
 
 		 342 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  44.85 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  46.06 
 
 		 337 aa  305  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  45.92 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  47.16 
 
 		 345 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  46.76 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  42.56 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  42.82 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  39.4 
 
 		 344 aa  258  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  42.56 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  40.18 
 
 		 331 aa  255  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  42.65 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  39.64 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  40.06 
 
 		 352 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  40.06 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  40.53 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  37.31 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  40.41 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  37.35 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  38.78 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  37.17 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  37.8 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  38.24 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  38.71 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  39.3 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  39.59 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  39 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  38.55 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  39.36 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  37.24 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  39.54 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  38.82 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  38.19 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  38.19 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  38.82 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  37.79 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  37.79 
 
 		 425 aa  225  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  38.53 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  39 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  38.19 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  36.95 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  36.8 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  39.77 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  37.94 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  38.64 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  37.61 
 
 		 371 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  36.28 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  35.82 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  38.19 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  37.46 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  36.18 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  37.28 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  36.73 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  43.34 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  38.78 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0127  ferrochelatase  36.12 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  39.31 
 
 		 371 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  36.66 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  38.3 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  37.68 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  38.53 
 
 		 345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  38.6 
 
 		 345 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  38.3 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  39.35 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  35.99 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  37.36 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  38.24 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  35.55 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  37.06 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  36.98 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  36.87 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  38.1 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  36.87 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  38.1 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  38.1 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  34.49 
 
 		 350 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  36.87 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  36.87 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  37.98 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  36.98 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  36.07 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  37.72 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  36.07 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  36.71 
 
 		 370 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  36.87 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  35.91 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  38.01 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  36.07 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  37.1 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>