155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1286 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1286  selenocysteine synthase  100 
 
 		 443 aa  894    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1380  selenocysteine synthase  61.59 
 
 		 440 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.924415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0273  selenocysteine synthase  61.82 
 
 		 440 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1569  selenocysteine synthase  61.36 
 
 		 440 aa  557  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.339371  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1546  selenocysteine synthase  51.37 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0540  selenocysteine synthase  50 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0831  selenocysteine synthase  45.82 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.322314  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2082  L-seryl-tRNA selenium transferase  48.34 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0765  L-seryl-tRNA selenium transferase  47.85 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.522445  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0755  selenocysteine synthase  47.38 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  47.38 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  47.12 
 
 		 462 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  39.09 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  38.53 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  42.04 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  39.77 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  38.43 
 
 		 476 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  36.42 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  43.16 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0506  selenocysteine synthase  38.2 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.487693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  36.88 
 
 		 472 aa  298  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  38.65 
 
 		 462 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  37.74 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  36.02 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  36.02 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  36.02 
 
 		 462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  36.29 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.68 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  38.35 
 
 		 506 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  39.32 
 
 		 491 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  36.95 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  36.52 
 
 		 478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  34.34 
 
 		 489 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  38.73 
 
 		 483 aa  273  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  39.69 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  37.56 
 
 		 472 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0412  selenocysteine synthase  33.68 
 
 		 491 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.47 
 
 		 476 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3369  selenocysteine synthase  35.87 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  35.11 
 
 		 519 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  36.73 
 
 		 491 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2152  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  33.99 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  36.99 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  36.29 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  35.12 
 
 		 470 aa  263  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  41.82 
 
 		 462 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  35.94 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.78 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  35.94 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  39.01 
 
 		 466 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1983  selenocysteine synthase  37 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.484837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  37.09 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  39.63 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  35.8 
 
 		 475 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  38.46 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  37.14 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  36.87 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  37.11 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4006  selenocysteine synthase  35.35 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0658  selenocysteine synthase  36.66 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  35.46 
 
 		 473 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3961  selenocysteine synthase  35.57 
 
 		 463 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4068  selenocysteine synthase  35.57 
 
 		 463 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3897  selenocysteine synthase  35.35 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3883  selenocysteine synthase  35.35 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  36.91 
 
 		 475 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  36.12 
 
 		 476 aa  246  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  34.39 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  38.58 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  38.79 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  36.84 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1692  L-seryl-tRNA selenium transferase  36.66 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.624404  normal  0.735525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  36.15 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  36.05 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  37.8 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  35.57 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3334  selenocysteine synthase  38.38 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.530246 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0488  L-seryl-tRNA selenium transferase  40.83 
 
 		 451 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  40.64 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  39.88 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4089  selenocysteine synthase  36.02 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0768  L-seryl-tRNA selenium transferase  33.83 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.204194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  34.59 
 
 		 463 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4006  selenocysteine synthase  35.78 
 
 		 463 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03446  selenocysteine synthase  35.79 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0117  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.79 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03397  hypothetical protein  35.79 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3796  selenocysteine synthase  35.79 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.915143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4962  selenocysteine synthase  35.79 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.922888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0122  selenocysteine synthase  35.79 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  35.73 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0442  selenocysteine synthase  35.11 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  35.47 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  35.47 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  35.47 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  35.47 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  35.47 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  35.47 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  36.6 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  36.73 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>