More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01340 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05490  chaperonin GroL  74.76 
 
 
543 aa  803    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  61.9 
 
 
541 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0184  chaperonin GroEL  66.85 
 
 
545 aa  713    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.79 
 
 
538 aa  651    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2820  chaperonin GroEL  83.9 
 
 
545 aa  876    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000232523  normal  0.159069 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01340  chaperonin GroL  100 
 
 
546 aa  1070    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
547 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  60.61 
 
 
544 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  59.81 
 
 
540 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  59.53 
 
 
539 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  58.95 
 
 
538 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  59.62 
 
 
541 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  58.24 
 
 
540 aa  619  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
544 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
544 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
544 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
544 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  59.43 
 
 
536 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  57.77 
 
 
538 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  57.77 
 
 
538 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  61.14 
 
 
546 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  59.92 
 
 
542 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  59.62 
 
 
547 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
545 aa  615  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
544 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
544 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
544 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  57.8 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  57.94 
 
 
543 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  58.06 
 
 
542 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
544 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
539 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
544 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  59.39 
 
 
539 aa  614  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
542 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  59.56 
 
 
539 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  58.06 
 
 
539 aa  610  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  57.97 
 
 
543 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  58.17 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  58.02 
 
 
539 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  56.56 
 
 
539 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  59.17 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  58.56 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  58.17 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  59.28 
 
 
540 aa  608  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  57.17 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  58.17 
 
 
541 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  57.83 
 
 
543 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  57.74 
 
 
546 aa  605  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  58.17 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  57.23 
 
 
548 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  58.94 
 
 
543 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  58.46 
 
 
548 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  58.21 
 
 
541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  56.49 
 
 
544 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  57.46 
 
 
542 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  57.48 
 
 
541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  57.8 
 
 
541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  58.56 
 
 
540 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0535  chaperonin GroEL  58.29 
 
 
547 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793994  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  57.77 
 
 
541 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  56.67 
 
 
543 aa  601  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  57.6 
 
 
544 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  58.67 
 
 
545 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  59.02 
 
 
547 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  59.02 
 
 
547 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  57.7 
 
 
544 aa  599  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  57.14 
 
 
540 aa  601  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  57.06 
 
 
539 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  57.06 
 
 
539 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  58.96 
 
 
542 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  58.61 
 
 
542 aa  601  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  56.31 
 
 
541 aa  598  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  56.33 
 
 
547 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  58.1 
 
 
547 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  58.16 
 
 
544 aa  595  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  57.61 
 
 
540 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  58.65 
 
 
547 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  59.13 
 
 
547 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  58.37 
 
 
543 aa  596  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  57.61 
 
 
541 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  58.71 
 
 
539 aa  596  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0579  chaperonin GroEL  57.9 
 
 
547 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158784  normal  0.586113 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  55.43 
 
 
544 aa  592  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  57.92 
 
 
541 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  58.27 
 
 
542 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  58 
 
 
540 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  58.22 
 
 
548 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  56.51 
 
 
543 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2964  chaperonin GroEL  55.79 
 
 
528 aa  592  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  57.71 
 
 
540 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  57.74 
 
 
540 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  57.84 
 
 
539 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  57.73 
 
 
540 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
545 aa  593  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  57.82 
 
 
540 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  57.92 
 
 
545 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  57.92 
 
 
545 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  57.22 
 
 
546 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0542  chaperonin GroEL  57.5 
 
 
551 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>