30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6622 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6622  Ricin B lectin  100 
 
 		 172 aa  358  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111925  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5090  Ricin B lectin  56.32 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326544  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3436  Ricin B lectin  42.14 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.17 
 
 		 489 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  30.2 
 
 		 469 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  29.31 
 
 		 492 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.5 
 
 		 982 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.06 
 
 		 487 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.37 
 
 		 474 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  30.3 
 
 		 489 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  32.12 
 
 		 558 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.06 
 
 		 568 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  30.37 
 
 		 374 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  32.12 
 
 		 603 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  27.94 
 
 		 627 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.03 
 
 		 803 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.8 
 
 		 516 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  32.89 
 
 		 417 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  33.61 
 
 		 1100 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  28.85 
 
 		 574 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  33.77 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  35.23 
 
 		 801 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  32.99 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  31.5 
 
 		 412 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 589 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  32.61 
 
 		 461 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  27.92 
 
 		 490 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  32.05 
 
 		 452 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.17 
 
 		 497 aa  40.8  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>