28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5090 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5090  Ricin B lectin  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326544  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6622  Ricin B lectin  56.32 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111925  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3436  Ricin B lectin  39.44 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.26 
 
 		 489 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 558 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  27.64 
 
 		 516 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.34 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  32.58 
 
 		 801 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.57 
 
 		 498 aa  44.3  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.37 
 
 		 627 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  28.15 
 
 		 472 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  28.33 
 
 		 497 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  26.99 
 
 		 493 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  37.1 
 
 		 487 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  28.37 
 
 		 548 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  26.56 
 
 		 672 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  25.18 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.21 
 
 		 490 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  23.33 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.5 
 
 		 497 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 		 858 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  34.31 
 
 		 800 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 		 858 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  34.31 
 
 		 800 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  34.31 
 
 		 858 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  34.31 
 
 		 807 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  27.93 
 
 		 427 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  34.31 
 
 		 805 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>