More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3250 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 462 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2681  AMP-dependent synthetase and ligase  59.07 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0693439  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2497  AMP-dependent synthetase and ligase  57.08 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 548 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 548 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3958  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 707 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  24.62 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 502 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5806  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 		 562 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154251  normal  0.312131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6813  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5547  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 544 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.730505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  28.03 
 
 		 503 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  23.43 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 485 aa  97.8  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 492 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  28.29 
 
 		 450 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3807  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00941755  normal  0.205802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  28.48 
 
 		 552 aa  97.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  25.61 
 
 		 548 aa  97.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3821  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3895  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.53 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  30.55 
 
 		 540 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.03 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 		 552 aa  94.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 		 555 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  28.11 
 
 		 535 aa  94  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3397  putative acyl-CoA synthetase  23.15 
 
 		 487 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 534 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1557  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 		 544 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6272  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 		 544 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417798  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.21 
 
 		 503 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 561 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  25.28 
 
 		 493 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  26.05 
 
 		 501 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  23.38 
 
 		 490 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 		 544 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  27.33 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  27.46 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.12 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 590 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 		 549 aa  90.9  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  29.1 
 
 		 533 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6761  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 544 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  25 
 
 		 504 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  27.91 
 
 		 509 aa  90.5  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 550 aa  90.5  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1677  amino acid adenylation domain-containing protein  28.66 
 
 		 1058 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  25.55 
 
 		 569 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 469 aa  90.1  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 		 537 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  28.68 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  27.43 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  28.2 
 
 		 549 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 550 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 583 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  23.98 
 
 		 569 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.06 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  27.29 
 
 		 544 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5361  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 544 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.521806  normal  0.341711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  26.12 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 511 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  30.59 
 
 		 524 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  24.57 
 
 		 504 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  25.11 
 
 		 564 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  23.14 
 
 		 539 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  27.31 
 
 		 535 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 		 520 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  26.42 
 
 		 555 aa  86.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  21.43 
 
 		 533 aa  86.7  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 591 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 541 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  28.74 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  23.8 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 584 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  29.89 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  26.29 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>