More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1677 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3545  amino acid adenylation domain-containing protein  46.67 
 
 		 1029 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1677  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 1058 aa  2100    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  50.84 
 
 		 1070 aa  941    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  35.98 
 
 		 1525 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  29.54 
 
 		 1533 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  29.84 
 
 		 1466 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  29.84 
 
 		 1466 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  30.44 
 
 		 1525 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  29.26 
 
 		 1533 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  30.15 
 
 		 2581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.62 
 
 		 1345 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  40.37 
 
 		 5230 aa  380  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  32.72 
 
 		 1816 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  32.66 
 
 		 2628 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  37.08 
 
 		 3291 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.42 
 
 		 3231 aa  360  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27.58 
 
 		 1833 aa  358  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  32.67 
 
 		 2606 aa  357  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.36 
 
 		 4960 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  28.09 
 
 		 4960 aa  354  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  27.6 
 
 		 1786 aa  352  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.19 
 
 		 4968 aa  350  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.46 
 
 		 2883 aa  349  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 		 1550 aa  348  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  31.92 
 
 		 2155 aa  345  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  25.05 
 
 		 2410 aa  343  7e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.47 
 
 		 4747 aa  342  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  30.43 
 
 		 2156 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  39.37 
 
 		 1358 aa  340  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  31.21 
 
 		 3235 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.32 
 
 		 3498 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  33.03 
 
 		 2137 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.72 
 
 		 3308 aa  334  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  28.73 
 
 		 2156 aa  333  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  35.62 
 
 		 2136 aa  333  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  30.46 
 
 		 2875 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  33.18 
 
 		 9175 aa  332  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  32.29 
 
 		 2419 aa  331  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  31.48 
 
 		 3230 aa  331  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  32.81 
 
 		 5149 aa  331  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0572  amino acid adenylation domain protein  29.74 
 
 		 1357 aa  330  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.48 
 
 		 2156 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  31.31 
 
 		 2350 aa  330  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2421  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  32.86 
 
 		 1044 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  25.65 
 
 		 1078 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.03 
 
 		 4502 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  34.91 
 
 		 1334 aa  329  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  30.36 
 
 		 5213 aa  329  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  27.59 
 
 		 3086 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  26.02 
 
 		 1556 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.04 
 
 		 3018 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  30.09 
 
 		 2561 aa  328  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  27.53 
 
 		 3086 aa  328  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  31.97 
 
 		 1990 aa  327  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.56 
 
 		 1806 aa  327  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.12 
 
 		 4882 aa  327  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  26.18 
 
 		 1556 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.88 
 
 		 1336 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  29.16 
 
 		 6202 aa  324  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  30.99 
 
 		 4037 aa  324  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.77 
 
 		 6403 aa  323  9.000000000000001e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  37.28 
 
 		 3224 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  25.42 
 
 		 1870 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 		 2386 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4121  amino acid adenylation domain protein  37.22 
 
 		 1583 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.183322  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  29.04 
 
 		 1454 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  31.78 
 
 		 2448 aa  323  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.67 
 
 		 2385 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.71 
 
 		 2385 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.92 
 
 		 2385 aa  321  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.92 
 
 		 2385 aa  321  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.59 
 
 		 8646 aa  320  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.92 
 
 		 2370 aa  320  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  25.33 
 
 		 1870 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.79 
 
 		 2820 aa  319  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.86 
 
 		 6889 aa  319  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 		 3331 aa  319  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  32.1 
 
 		 1083 aa  319  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  31.81 
 
 		 7785 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.8 
 
 		 4991 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.95 
 
 		 3432 aa  318  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.66 
 
 		 2385 aa  318  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  37.38 
 
 		 5422 aa  318  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.18 
 
 		 5596 aa  317  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.89 
 
 		 2386 aa  317  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  27.99 
 
 		 1093 aa  317  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.26 
 
 		 2385 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  32.42 
 
 		 8211 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.9 
 
 		 5926 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  25.15 
 
 		 2193 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  31.66 
 
 		 1726 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33 
 
 		 7712 aa  315  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  31.64 
 
 		 4383 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.7 
 
 		 3176 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.99 
 
 		 4478 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.82 
 
 		 2385 aa  314  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  28.63 
 
 		 7168 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.74 
 
 		 3291 aa  314  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  31.12 
 
 		 5654 aa  314  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.24 
 
 		 1829 aa  314  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>